Diferența cheie dintre sondele ADN și ARN este că sondele ADN sunt fragmente de ADN care sunt complementare cu secvențele de nucleotide țintă, în timp ce sondele ARN sunt întinderi de ARN monocatenar care sunt secvențe complementare de acid nucleic ale secvențelor țintă.
O sondă este o secvență scurtă sintetizată artificial de ADN sau ARN care ar putea fi marcată radioactiv sau cu molecule neradioactive. Poate avea o lungime de la 100 la 1000 de baze. Sondele sunt utile în detectarea secvenţelor de nucleotide ţintă care sunt complementare cu secvenţa sondei. Odată adăugate, sondele se hibridizează cu secvențele complementare sau cu secvențele țintă și o fac vizibilă pentru a identifica secvențele țintă, deoarece poartă radioactivitate. Sondele sunt instrumente moleculare importante pentru multe domenii microbiene și moleculare, cum ar fi detectarea bolilor genetice, în virologie, în patologia criminalistică, în testarea paternității, în amprentarea ADN, RFLP, citogenetica moleculară, hibridizarea in situ etc.
Ce sunt sondele ADN?
Sondele ADN sunt întinderi monocatenar de ADN. Ele pot fi utilizate pentru a detecta prezența secvențelor complementare de acid nucleic (secvențe țintă) prin hibridizare. Odată ce o sondă ADN hibridizată cu secvența sa complementară, formează un hibrid dublu catenar. Pentru a le detecta, sondele ADN sunt în general marcate cu radioizotopi, biotină, epitopi sau fluorofori. Sondele ADN marcate cu biotină pot fi detectate cu fosfatază alcalină marcată cu streptavidină printr-o serie de metode enzimatice și chimice.
Figura 01: Sondă ADN
Secvența de nucleotide a sondei ADN este cunoscută. Sunt secvențe scurte cu o lungime de 100 până la 1000 de perechi de baze. Sondele lungi de ADN pot fi generate prin tehnologia ADN-ului recombinant. Ele pot fi, de asemenea, generate prin PCR și clonare. În laboratoarele de microbiologie clinică, sondele ADN sunt disponibile cu ușurință pentru diagnosticarea rapidă a bolilor infecțioase.
Ce sunt sondele ARN?
Sondele ARN sunt întinderi monocatenar de ARN. Sunt secvențe complementare cu secvențele țintă din probă. Ele sunt sintetizate în mod obișnuit cu ARN polimerazele de la bacteriofagi SP6, T7 sau T3 prin transcrierea in vitro a ADN-ului. Probe lungi de ARN pot fi generate prin transcripție in vitro din ADN plasmid liniarizat. În general, sondele ARN se leagă puternic și mai strâns de secvențele lor complementare decât sondele ADN. Similar cu sondele ADN, sondele ARN pot fi, de asemenea, marcate în timp ce sunt transcrise.
Care sunt asemănările dintre sondele ADN și ARN?
- Atât sondele de ADN, cât și de ARN sunt secvențe de nucleotide monocatenar.
- Ambele sunt proiectate și sintetizate artificial.
- În plus, ele pot fi etichetate cu radioizotopi, epitopi, biotină sau fluorofori.
- Au o afinitate puternică față de o anumită secvență țintă de ADN sau ARN.
- Sunt utilizați în diferite tehnici de blotting și hibridizare in situ pentru detectarea secvențelor țintă de acid nucleic.
- Ambele tipuri de sonde pot fi hibridizate cu secvențele lor complementare.
- Ele sunt, de asemenea, utilizate în identificarea microorganismelor și în diagnosticarea bolilor infecțioase, moștenite și a altor boli.
Care este diferența dintre sondele ADN și ARN?
Sonda ADN este o întindere scurtă de ADN care este complementară cu secvența țintă. Pe de altă parte, sonda ARN este o scurtă întindere monocatenară de ARN complementară secvenței țintă. Astfel, aceasta este diferența cheie dintre sondele ADN și ARN. În plus, sondele ADN conțin A, T, C și G, în timp ce sondele ARN conțin A, U, C și G.
În plus, o altă diferență între sondele ADN și ARN este stabilitatea lor termodinamică. Sondele ARN prezintă o stabilitate termodinamică mai mare în comparație cu sondele ADN.
Mai jos infograficul prezintă diferențele importante dintre sondele ADN și ARN.
Rezumat – Sonde ADN vs ARN
O sondă este un fragment mic de ADN sau ARN utilizat pentru a detecta prezența unei secvențe specifice în proba de ADN sau ARN prin hibridizare moleculară. Sondele ADN sunt fragmente scurte de ADN monocatenar, în timp ce sondele de ARN sunt secvențe scurte de ARN monocatenar. Sunt secvențe cunoscute. Stabilitatea termodinamică este mai mare în sondele ARN decât în sondele ADN. Sondele ARN se leagă strâns de secvențele lor complementare decât se leagă sondele ADN. Astfel, aceasta rezumă diferența dintre sondele ADN și ARN.