Diferența cheie dintre secvența Shine Dalgarno și Kozak este că secvența Shine Dalgarno este un loc de legare ribozomal în ARN-ul mesager bacterian și arheal, în timp ce secvența Kozak este un situs de inițiere a translației proteinelor în majoritatea ARN-urilor mesager eucariote.
Shine Dalgarno și secvența Kozak sunt două secvențe consens care sunt foarte importante pentru inițierea traducerii. În biologia moleculară, translația este procesul prin care ribozomii din citoplasmă sintetizează proteine după procesul de transcripție. În traducere, un ARNm (ARN mesager) este decodificat într-un ribozom pentru a produce un lanț specific de aminoacizi în afara nucleului. În mod obișnuit, un ribozom induce procesul de decodificare prin facilitarea legării secvențelor complementare de anticodon ARNt la codonii ARNm. Traducerea se desfășoară în trei etape: inițiere, alungire și terminare.
Ce este Secvența Shine Dalgarno?
Secvența Shine Dalgarno este un loc de legare ribozomal în ARN-ul mesager bacterian și arheal. Este situat în general în jurul a 8 baze în amonte de codonul de început AUG. Această secvență de ARN ajută la recrutarea ribozomilor la ARN-ul mesager prin alinierea ribozomului cu un codon de început ARNm. Astfel, inițiază sinteza proteinelor. Odată după recrutare, ARNt poate adăuga aminoacizi în secvență, așa cum este dictat de codonii ARNm. Această secvență specială este comună în bacterii, dar mai rară în arhee. Mai mult, este prezent și în transcrierile de cloroplaste și mitocondrie. Secvența Shine Dalgarno a fost propusă pentru prima dată de oamenii de știință australieni John Shine și Lynn Dalgarno. Secvența consens de șase baze este AGGAGG. De exemplu, în Escherichia coli secvența este AGGAGGU.
Figura 01: Secvența Shine Dalgarno
Selecția locului de inițiere (AUG) depinde de interacțiunea dintre subunitatea 30S a ribozomului și șablonul ARNm. Regiunea bogată în pirimidină de pe componenta 16srARN a subunității 30S se leagă de regiunea bogată în purine cunoscută sub numele de secvența Shine Dalgarno în amonte de codonul de inițiere AUG din ARNm. Mai mult, în timpul formării complexului de inițiere, aceste secvențe de nucleotide complementare se împerechează pentru a forma o structură de ARN dublu catenar. Acest lucru facilitează legarea ARNm la un ribozom în așa fel încât codonul de inițiere este plasat la locul P al ribozomului.
Ce este secvența Kozak?
Secvența Kozak este un situs de inițiere a translației proteinei în majoritatea ARNm eucariote. Această secvență mai este numită și secvența consens Kozak. Secvența Kozak este secvența optimă pentru inițierea translației la eucariote. Această secvență este un aspect integral al reglării proteinelor. De asemenea, este foarte important pentru sănătatea celulară generală. Ajută la corectarea traducerii proteinelor din mesajele genetice prin medierea ansamblării ribozomilor și inițierea traducerii.
Figura 02: Secvența Kozak
Această secvență a fost numită după omul de știință care a descoperit-o, Marilyn Kozak. Ea a descoperit-o printr-o analiză detaliată a secvențelor genomice ADN. Secvența Kozak este 5’ (gcc) gccRccAUGG-3’. Literele mari indică baze conservate, în timp ce literele mici indică baze variabile comune. R indică o purină (adenină sau guanină) care este întotdeauna poziționată în această locație.
Care sunt asemănările dintre Shine Dalgarno și secvența Kozak?
- Shine Dalgarno și secvența Kozak sunt două secvențe consens care sunt foarte importante în inițierea traducerii.
- Ambele sunt secvențe de ARN.
- Subunitatea mai mică a ribozomului se leagă de ambele secvențe.
- Ambele secvențe mediază ansamblul ribozomului adecvat și inițierea translației.
- Sunt aspecte integrante ale reglării proteinelor și ale sănătății celulare generale.
Care este diferența dintre Shine Dalgarno și secvența Kozak?
Secvența Shine Dalgarno este un situs de legare ribozomal găsit în ARN-ul mesager bacterian și arheal, în timp ce secvența Kozak este un situs de inițiere a translației proteinei găsit în majoritatea ARN-ului mesager eucariotic. Deci, aceasta este diferența cheie dintre secvența Shine Dalgarno și Kozak. În plus, secvența Shine Dalgarno este 5’AGGAGGU3’ în timp ce secvența Kozak este 5’ (gcc) gccRccAUGG-3’.
Următorul infografic listează diferențele dintre succesiunea Shine Dalgarno și Kozak în formă tabelară pentru comparare una lângă alta.
Rezumat – Secvența Shine Dalgarno vs Kozak
Secvențele Shine Dalgarno și Kozak sunt două secvențe de ARN consens care sunt foarte importante pentru asamblarea ribozomilor și inițierea translației. Secvența Shine Dalgarno este un loc de legare ribozomal în ARN-ul mesager bacterian și arheal, în timp ce secvența Kozak este un situs de inițiere a translației proteinei în majoritatea ARN-ului mesager eucariotic. Astfel, aceasta rezumă diferența dintre secvența Shine Dalgarno și Kozak.
