Diferența cheie dintre cianul de xilen și albastrul de bromofenol este că, în gel de agaroză 1%, cianolul de xilen migrează mai lent, în timp ce albastrul de bromofenol migrează mai repede.
Xilen cianul și albastrul de bromofenol sunt importanți ca markeri de culoare care pot fi utilizați în monitorizarea procesului de electroforeză pe gel de agaroză și electroforeză pe gel de poliacrilamidă.
Ce este cianul de xilen?
Xilen cianul este un marker de culoare electroforetic sau un colorant de urmărire. Este util în monitorizarea procesului de electroforeză pe gel de agaroză și electroforeză pe gel de poliacrilamidă. Când această substanță este amestecată cu proba, concentrația acestei substanțe devine de obicei aproximativ 0.005% până la 0,03%. Unele sinonime pe care le putem folosi pentru xilen cianol includ Acid Blue 147, xilen cianol, xilen cianol FF, xilen cianol FF etc.
Formula chimică a acestui compus este C25H27N2NaO 6S2 Masa molară a xilen-cianolului este de 538,61 g/mol. Această substanță poate migra cu o viteză de aproximativ 4 – 5 fragmente de ADN de perechi kilobaze în geluri de agaroză 1%. Totuși, acest lucru depinde de tamponul pe care îl folosim. De obicei, cianolul de xilen pe gel de poliacrilamidă 6% poate migra la o viteză de aproximativ 140 de fragmente de ADN de perechi de baze. Pe de altă parte, poate migra în electroforeză cu gel de poliacrilamidă denaturant 20% la o rată de oligonucleotidă de 25 de baze.
Numărul de donatori de legături de hidrogen ai xilen cianului este de 2 m, iar numărul de acceptori ai legăturilor de hidrogen este 8. Numărul de legături rotative ale acestui compus poate fi dat ca 7. Complexitatea xilen cianului poate fi descrisă ca 1120 de grade. Are un număr definit de stereocentre de legătură de 1.
Ce este albastrul de bromofenol?
Albastrul de bromofenol este un indicator de pH util care este util ca marker electroforetic de culoare și colorant. Are denumirea chimică 3’, 3”, 5’, 5”-tetrabromofenolsulfonftaleină, BPB. Formula chimică a acestui compus este C19H10Br4O5 S. Masa molară a acestui compus este de 669,96 g/mol. Este inodor, iar densitatea sa poate fi dată ca 2,2 g/mL. Punctul său de topire este de 273 de grade Celsius, iar punctul de fierbere este de 279 de grade Celsius. Îl putem pregăti adăugând încet excesul de brom la o soluție fierbinte de fenolsulfonftaleină în acid acetic glacial.
Albastrul de bromofenol este util ca indicator acido-bazic în intervalul între pH 3,0 și 4,6. Este capabil să se schimbe de la galben la pH 3,0 la pH 4,6. În plus, este o reacție reversibilă. Din punct de vedere structural, albastrul de bromofenol este similar cu fenolftaleina.
În plus, îl putem folosi ca marker de culoare pentru a monitoriza procesul de electroforeză pe gel de agaroză și electroforeză pe gel de poliacrilamidă. Această substanță poate purta o sarcină negativă la pH moderat, unde poate migra în aceeași direcție cu ADN-ul sau proteina dintr-un gel. Rata de migrare poate varia în funcție de densitatea gelului și compoziția tamponului. Cu toate acestea, într-un gel tipic de agaroză 1% într-un tampon TAE sau tampon TBE, această substanță migrează în aceeași viteză ca un fragment de ADN de aproximativ 300 de perechi de baze.
Care este diferența dintre cianul de xilen și albastrul de bromofenol?
Xilen cianul și albastrul de bromofenol sunt markeri de culoare importanți. Diferența esențială dintre cianolul de xilen și albastrul de bromofenol este că, în gel de agaroză 1%, cianolul de xilen migrează mai lent, în timp ce albastrul de bromofenol migrează mai repede.
Mai jos este un rezumat al diferenței dintre xilen cianol și albastru de bromofenol sub formă tabelară pentru comparație una lângă alta.
Rezumat – Xilen Cyanol vs Bromophenol Blue
Xilen cianul și albastrul de bromofenol sunt importanți ca markeri de culoare utilizați în monitorizarea procesului de electroforeză pe gel de agaroză și electroforeză pe gel de poliacrilamidă. Diferența esențială dintre cianolul de xilen și albastrul de bromofenol este că, în gel de agaroză 1%, cianolul de xilen migrează mai lent, în timp ce albastrul de bromofenol migrează mai repede.
