Diferența cheie dintre QTL și GWAS se bazează pe tipul de secvențe utilizate în analiză. QTL folosește loci genei de legătură pentru a analiza trăsăturile fenotipice asociate cu moștenirea poligenă, în timp ce GWAS utilizează secvențe întregi ale genomului pentru a analiza polimorfismele de un singur nucleotide ale unei anumite stări.
Hărțile QTL și GWAS joacă un rol important în analizele genetice pentru diferite trăsături. În plus, ele sunt importante în analiza diferitelor stări de boală cu etiologie necunoscută. În plus, secvențierea joacă un rol cheie în ambele tehnici. Aceste tehnici pot fi în continuare cuplate cu alte tehnici de producție mare pentru o acuratețe și precizie sporite.
Ce este QTL?
QTL înseamnă Cantitative Trait Locus. Este o regiune a ADN-ului asociată cu o trăsătură fenotipică. În general, un QTL dă naștere la efecte poligenice. Distribuția QTL-urilor variază, iar numărul de QTL-uri sugerează gradul de variație a unei anumite trăsături fenotipice. În plus, ele codifică de obicei trăsăturile continue subiacente și nu trăsăturile discrete.
După identificarea regiunilor QTL, este important să ordonați o anumită zonă QTL. Mai mult, pentru a face investigațiile și cercetările ușoare, secvențierea și stocarea datelor secvențe ale regiunilor QTL comune au loc cu implicarea bioinformaticii. Numim această tehnică mapare QTL. Ulterior, se creează o bază de date cu secvențele regiunii QTL.
Figura 01: Scanare QTL
În plus, aplicațiile secvențelor QTL se bazează în principal pe instrumentul BLAST, unde se poate determina asemănarea secvenței. Este important în deducerea relațiilor dintre organisme. În plus, este important în determinarea complexității unui anumit fenotip poligenic. De asemenea, determină evoluția unei anumite trăsături.
În prezent, analiza QTL este combinată cu alte tehnici de mare capacitate, cum ar fi micromatricele ADN. Acest lucru este important în analiza expresiei fenotipului. În prezent, oamenii de știință sunt foarte interesați de dezvoltarea bazei de date QTL, deoarece regiunile QTL sunt responsabile pentru multe trăsături importante ale diferitelor specii.
Ce este GWAS?
GWAS înseamnă Genome Wide Association Study. De asemenea, se referă la studii de asociere a întregului genom. Aceste studii se concentrează în principal pe studii observaționale. Analizează variantele genetice ale diferiților indivizi asociate de obicei cu o trăsătură specifică. În plus, întregul genom este important pentru analiza GWAS.
Figura 02: GWAS
GWAS este un instrument important în analiza polimorfismelor unice de nucleotide asociate cu diferite boli. Acesta este, de asemenea, un studiu comparativ al diferitelor polimorfisme de nucleotide individuale dintr-o populație largă. În plus, eșantionul de studiu al GWAS este foarte mare; prin urmare, ia și formatul unui studiu de cohortă transversal.
În plus, primul studiu GWAS a avut loc cu privire la infarctul miocardic și analizarea genelor asociate cu infarctul miocardic. În prezent, GWAS joacă un rol important în determinarea fondului genetic al bolilor complexe cu etiologie necunoscută.
Care sunt asemănările dintre QTL și GWAS?
- Se bazează pe datele secvențelor ADN pentru analiză.
- Ambele sunt asociate cu mediile genetice ale diferitelor personaje.
- În plus, au nevoie de instrumente bioinformatice pentru a deduce și interpreta rezultate.
- Se fac pe populații mari.
Care este diferența dintre QTL și GWAS?
QTL analizează trăsăturile fenotipice asociate cu moștenirea poligenică folosind loci genetici legați, în timp ce GWAS analizează polimorfismele de un singur nucleotide ale unei anumite stări folosind secvențe întregi de genom. Astfel, aceasta este diferența cheie dintre QTL și GWAS. Maparea QTL este comparativ o tehnică mai puțin complexă decât GWAS, deoarece necesită secvențierea întregului genom.
Infografia de mai jos rezumă diferența dintre QTL și GWAS sub formă tabelară.
Rezumat – QTL vs GWAS
Cartările QTL și GWAS joacă un rol major în determinarea fondului genetic al diferitelor trăsături fenotipice. Ele ajută, de asemenea, la analiza fondului genetic al diferitelor boli. Cartografierea QTL hărește genele de legătură responsabile pentru trăsăturile continue și implică, de asemenea, cartografierea genelor moștenire poligenică. GWAS, pe de altă parte, are loc cu analiza întregului genom pentru polimorfisme cu o singură nucleotidă. În plus, acest lucru are loc într-o populație mai mare. Astfel, acesta este rezumatul diferenței dintre QTL și GWAS.
