Diferența cheie dintre gena candidată și GWAS este că abordarea genei candidate investighează variația genetică într-un număr mic de gene de interes prespecificate, în timp ce GWAS investighează întregul genom pentru o variație genetică comună din spatele unei anumite boli.
Abordarea genetică candidată și studiile de asociere la nivel de genom (GWAS) sunt două metode care sunt importante pentru a detecta susceptibilitatea genetică la boli. Abordarea genelor candidate se bazează pe un număr mic de gene prespecificat, în timp ce GWAS se bazează pe testarea întregului genom. Prin urmare, abordarea genelor candidate necesită cunoștințe prealabile despre genele relevante pentru boală, spre deosebire de GWAS.
Ce este gena candidată?
Abordarea genelor candidate este una dintre tehnicile care investighează asocierea dintre variația genetică în cadrul genelor de interes prespecificate și fenotipurile sau stările de boală. În această abordare, este necesar să aveți cunoștințe prealabile despre impactul funcțional biologic al genei asupra trăsăturii sau bolii în cauză. Pe baza acestor cunoștințe, un număr mic de gene sunt selectate și analizate pentru variația genetică.
Figura 01: Abordarea genetică candidată
Selectarea genelor se face pe baza relevanței biologice, fiziologice și funcționale pentru boala în cauză în această abordare. Această abordare este adesea concepută ca un studiu caz-control.
Ce este GWAS?
GWAS înseamnă Genome-Wide Association Study. De asemenea, se referă la studii de asociere a întregului genom. Aceste studii se concentrează în principal pe studii observaționale. Ei analizează variantele genetice ale diferiților indivizi asociate de obicei cu o trăsătură specifică. Întregul genomul este important pentru analiza GWAS.
GWAS este un instrument important în analiza polimorfismelor unice de nucleotide asociate cu diferite boli. Este un studiu comparativ al diferitelor polimorfisme de nucleotide individuale dintr-o populație largă. Eșantionul de studiu al GWAS este foarte mare; prin urmare, ia și formatul unui studiu de cohortă transversal.
Figura 02: GWAS
Primul studiu GWAS a avut loc cu privire la infarctul miocardic și analizarea genelor asociate cu infarctul miocardic. În prezent, GWAS joacă un rol important în determinarea fondului genetic al bolilor complexe cu etiologie necunoscută.
Care sunt asemănările dintre gena candidată și GWAS?
- Atât abordarea genelor candidate, cât și GWAS sunt tehnici care analizează asocierea genetică dintre genotip și fenotipul bolii.
- Ambele abordări ajută la înțelegerea bazei genetice a susceptibilității la boli.
Care este diferența dintre gena candidată și GWAS?
Abordarea genelor candidate se bazează pe genele candidate sau pe genele prespecificate, în timp ce GWAS se bazează pe întregul genom. Deci, aceasta este diferența cheie dintre gena candidată și GWAS. De asemenea, în abordarea genelor candidate, selecția genelor este necesară, în timp ce nu este necesară în GWAS.
În plus, abordarea genelor candidate necesită cunoștințe prealabile despre genele relevante pentru boală, în timp ce nu este necesară pentru GWAS.
Infograficul de mai jos oferă o comparație mai detaliată legată de diferența dintre gena candidată și GWAS.
Rezumat – Gene candidată vs GWAS
Gena candidată și GWAS sunt două studii de asociere a genelor. Abordarea genelor candidate se concentrează pe variația genetică asociată cu boala într-un număr mic de gene prespecificate. În schimb, GWAS investighează variația genetică asociată cu boala în întregul genom. Deci, aceasta este diferența cheie dintre gena candidată și GWAS. Ambele metode sunt importante pentru înțelegerea bazei genetice a susceptibilității la boli.
