Diferența cheie – Exome vs Transcriptome
O genă conține regiuni codificatoare și necodificatoare în ea. Secvențele de codificare sunt cunoscute sub numele de exoni, iar secvențele necodificatoare sunt cunoscute ca introni. Secvența de nucleotide a exonilor unei gene reprezintă codul genetic al genei pentru a sintetiza proteina specifică. Prin urmare, exonii rămân în molecula de ARNm. Regiunea totală a exonului a genomului este cunoscută sub numele de exom și este o parte importantă a genomului. Codul genetic al genelor este convertit în codul genetic al moleculei de ARNm, care este necesar pentru producerea de proteine. Moleculele întregi de ARNm transcrise într-o celulă sau într-o populație de celule la un moment dat sunt cunoscute ca transcriptom. Diferența cheie dintre exom și transcriptom este că exomul reprezintă secvențele regiunilor exonilor ale genomului, în timp ce transcriptomul reprezintă ARNm total al unei celule sau al unui țesut la un moment dat.
Ce este Exome?
Genele sunt compuse din exoni, introni și secvențe reglatoare. Exonii sunt regiunile genice care sunt transcrise în secvența de ARNm în timpul transcripției. Intronii și alte regiuni necodante sunt îndepărtate în timpul transcripției. Secvența de nucleotide a exonilor determină codul genetic al genei care sintetizează proteina specifică pe care o codifică. Doar exonii rămân în mARN-ul unei proteine. Colecția de exoni din genom este cunoscută ca exom al unui organism. Reprezintă o parte a genomului care este exprimată în gene. La om, exomul reprezintă 1% din genom. Este porțiunea care codifică proteinele din genomul uman.
Figura 01: Exome
Ce este Transcriptome?
Transcriptomul este colecția tuturor transcriptelor (ARN) care codifică și necodifică proteine dintr-un țesut dat. Transcriptomul reprezintă colecția totală de molecule de ARNm exprimate de gene într-o celulă sau un țesut. Transcriptomul unei celule poate fi variat cu transcriptomul altui tip de celulă. Transcriptomul este, de asemenea, dinamic – se modifică în timp ca răspuns la stimulii interni și externi. Chiar și în același țesut sau în același tip de celulă, transcriptomul se poate schimba după câteva minute.
Transcriptomul diferă de exomul unui organism. Transcriptomul include numai secvențele exomului exprimate. Deși exomul unei celule rămâne același, transcriptomul diferă între celule, deoarece expresia genei nu este aceeași pentru toate celulele sau țesuturile. Doar genele esențiale sunt exprimate în diferite celule și țesuturi. Expresia genelor este un proces specific de tip țesut sau celulă. Este reglementată de diverși factori, inclusiv factori de mediu. Prin urmare, transcriptomul poate varia în funcție de condițiile de mediu externe.
Transcriptomul este folosit ca precursor pentru studiile de proteomică. Toate proteinele sunt derivate din secvențe de ARNm. Modificările translaționale pot duce la modificări ale proteinelor. Cu toate acestea, transcriptomul oferă informații de bază importante pentru studiile proteomice.
Figura 02: Transcriptom al celulelor stem embrionare
Care este diferența dintre Exome și Transcriptome?
Exome vs Transcriptome |
|
| Exome este o colecție de regiuni care codifică proteine ale genelor. | Transcriptomul este colecția tuturor ARN-ului transcris, inclusiv ARNm. |
| Eșantion | |
| Exomul este studiat folosind o probă de ADN. | Transcriptomul este studiat folosind o probă de ARN. |
| Metoda de studiu | |
| Secvențierea întregului exom este metoda de studiu a exomului. | Secvențierea ARN este metoda de studiu a transcriptomului. |
Rezumat – Exome vs Transcriptome
Exonii sunt secvențele de codificare ale genelor și determină secvențele de ARNm ale proteinelor. Colecția acestor secvențe de codificare (exoni) este cunoscută ca exom al unui organism. Genele sunt transcrise în molecule de ARNm înainte de a produce proteine. Moleculele totale de ARNm ale unei celule sau ale unui țesut la un moment dat sunt cunoscute sub numele de transcriptom. Transcriptomul reprezintă genele care sunt exprimate activ în ARNm la un moment dat. Transcriptomul este specific celulelor și țesutului și afectează condițiile de mediu. Aceasta este diferența dintre exom și transcriptom.
