Diferența cheie dintre PCR consens și pan PCR este că PCR consens vizează întotdeauna regiuni conservate, în timp ce Pan PCR vizează regiuni variabile pentru a identifica diferite tulpini ale unui grup
Reacția în lanț a polimerazei (PCR) este o tehnică de amplificare a genelor care constă din trei etape principale ca denaturare, recoacere și extensie. Acesta este utilizat pe scară largă în diagnosticare și identificare moleculară. Tehnicile PCR de consens și Pan PCR se bazează pe țintele primer pe care le utilizează fiecare tip de PCR.
Ce este Consensus PCR?
PCR de consens este o tehnică PCR care vizează o regiune conservată pentru o anumită specie sau gen. Prin urmare, regiunile foarte conservate sunt alese pentru amplificare. Prin această metodă, organismele pot fi identificate și distinse pe baza consensului lor. Această metodă identifică o regiune conservată pentru o anumită specie. De exemplu, regiunea 16s ARNr a bacteriilor rămâne o regiune conservată printre bacterii. Prin urmare, este necesar un singur set de primeri pentru amplificare. În cele mai multe cazuri, un primer universal specific poate fi utilizat pentru regiunea conservată.
Figura 01: Tehnica PCR
Urmând o metodă PCR de consens, se pot deduce caracterizarea speciilor și relațiile evolutive. Pe baza eficienței de amplificare a organismului eșantion particular, poate fi dedus și consensul organismului față de grup. În plus, efectuarea unei PCR de consens este vitală în studiile filogenetice. Permite identificarea unei specii și interpretează abaterea organismului specific prezentată în termeni de strămoș comun.
Ce este Pan PCR?
Un PCR Pan este un mod de multiplexare al PCR. În această tehnică, diferite tulpini sunt amplificate folosind diferite ținte de primer. Țintele, totuși, pot fi ținte comune pentru grupurile de tulpini. Astfel, în Pan PCR, mai mult de două seturi de primeri pot fi utilizate simultan. Poate avea loc într-o metodă de reacție cu un singur tub sau ca metodă de reacție cu mai multe tuburi. Pan PCR este mai consumatoare de timp și mai complexă în comparație cu o PCR de consens. Din acest motiv, interpretarea rezultatelor PCR poate fi, de asemenea, mai complexă în Pan PCR.
Aplicația principală a Pan PCR este în diagnosticarea moleculară. Permite distingerea între diferitele tulpini ale unei specii prin amplificarea țintei. Pan PCR este o tehnică ideală pentru a identifica diferite tulpini ale unei singure specii care cauzează o boală. În cele mai multe cazuri, automatizarea tehnicilor Pan PCR pentru diferite condiții de sănătate este foarte importantă și este o tehnică fiabilă și extrem de eficientă.
Care sunt asemănările dintre PCR de consens și PCR pan?
- Consensus PCR și Pan PCR sunt două tipuri de tehnici PCR.
- Ambele proceduri urmează procedura generală în trei etape – denaturare, recoacere și extensie.
- Ei folosesc grunduri care sunt specifice țintei.
- Ambele reacții au loc într-un termociclator.
- Aceste reacții pot fi automatizate.
- Ambele pot fi utilizate în diagnosticarea și identificarea moleculară; cu toate acestea, precizia variază.
- Aceste proceduri necesită validare.
Care este diferența dintre PCR de consens și PCR pan?
Atât Consensus, cât și Pan PCR urmează aceeași procedură de rutină. Cu toate acestea, diferența cheie dintre PCR consens și Pan PCR se bazează pe țintele de primer pe care le utilizează fiecare procedură. În timp ce PCR de consens vizează întotdeauna regiuni conservate, o PCR Pan vizează regiuni variabile pentru a identifica diferite tulpini ale unui grup. Datorită acestei diferențe, protocoalele de proiectare a primerului, numărul de seturi de primeri utilizate și aplicațiile specifice variază.
Infografia de mai jos rezumă diferența dintre Consensus PCR și Pan PCR.
Rezumat – PCR consens vs PCR pan
PCR, introdus de Mulli, joacă un rol revoluționar important în aplicațiile de biologie moleculară. Consensus și Pan PCR sunt două tipuri de PCR bazate pe regiunile țintă a primerului. În timp ce PCR de consens vizează regiunile conservate, Pan PCR vizează regiuni variabile și joacă un rol important în identificarea tulpinilor. Datorită acestei diferențe de bază între PCR consens și Pan PCR, funcțiile specifice ale fiecărui tip de PCR variază, de asemenea, de la analiza filogenetică la caracterizarea moleculară până la diagnosticarea moleculară.
