Diferența cheie dintre primer și promotor este că primerul este o secvență scurtă de ADN sintetizată comercial, care este utilizată în PCR pentru amplificarea unei secvențe de ADN țintă, în timp ce promotorul este o secvență specifică de ADN care oferă un situs inițial de legare sigur pentru ARN polimerază și factori de transcripție pentru a iniția transcripția.
Primer și promotor sunt două tipuri de secvențe ADN. Primerul este un mic fragment de ADN necesar pentru reacția în lanț a polimerazei (PCR). Are secvențe scurte de nucleotide complementare capătului de flancare al catenei de ADN. Există două tipuri de primeri și aceștia funcționează ca puncte de plecare pentru sinteza noilor catene de ADN. În contrast, un promotor este o secvență specifică de ADN situată în amonte de situsul de inițiere a transcripției al unei gene. Interacționează direct cu componentele mecanismului de transcripție, cum ar fi ARN polimeraza și factorii de transcripție, pentru a controla transcripția ADN-ului. Prin urmare, ARN polimeraza și alți factori de transcripție se leagă de secvența promotorului și inițiază transcripția.
Ce este un primer?
Primerii sunt secvențe scurte de ADN concepute pentru amplificarea secvențelor de ADN țintă. Din punct de vedere structural, ele posedă secvențe scurte de nucleotide complementare capetelor de flancare ale catenelor duble de ADN. De obicei, au o lungime de aproximativ 20 de nucleotide. În timpul PCR, polimeraza Taq catalizează adăugarea de nucleotide în secvența de nucleotide preexistentă. Prin urmare, primerii servesc ca puncte de plecare pentru sinteza noilor catene. Taq polimeraza funcționează numai în direcția 5’ până la 3’. Prin urmare, sinteza ADN-ului are loc și în aceeași direcție 5’ până la 3’. Deoarece ADN-ul este dublu catenar, sunt necesare două tipuri de primeri în PCR. Ele sunt cunoscute ca primer primer și primer invers, pe baza direcției de alungire a primerului în timpul sintezei ADN.
Figura 01: Grunduri
Primerul direct se alipește cu catenă de ADN antisens și inițiază sinteza catenei + a genei în direcția 5’ până la 3’. Are o secvență scurtă de nucleotide care este complementară capătului de flancare 3’ al catenei antisens. Primerul invers se alipește cu catena de sens și inițiază sinteza unei catene complementare a catenei codificatoare, care este – o catenă a genei în direcția 5’ până la 3’. Astfel, primerul invers este proiectat complementar capătului 3’ al catenei de codificare. Atât primerii inversi, cât și cei directe sunt importanți pentru producerea de milioane până la miliarde de copii ale anumitor regiuni ale ADN-ului care sunt vizate sau interesate.
Ce este un promotor?
Promotorul este o secvență de ADN situată în amonte sau la capătul 5′ al situsului de inițiere a transcripției unei gene. Acesta oferă un situs de legare pentru ARN polimeraza și anumite elemente de reglare pentru a iniția transcripția genei. Este o secvență de reglementare necesară pentru pornirea sau oprirea unei gene. Există o secvență specifică de nucleotide în promotor. Poate avea 100-1000 de perechi de baze. Promotorul arată direcția transcripției. Mai mult, indică firul de simț care ar trebui transcris.
Figura 02: Promotorul unei gene
Există trei tipuri de elemente promotor ca promotor central, promotor proximal și promotor distal. Promotorul de bază este porțiunea minimă a promotorului necesară pentru a iniția transcripția. Este situat cel mai proximal de codonul de start. Cutia TATA este o regiune conservată găsită în mulți promotori de miez eucarioți. Se găsește 25 până la 35 de perechi de baze în amonte de locul de pornire a transcripției. Promotorul proximal se găsește mai în amonte de promotorul miez. În general, este situat la 250 de perechi de baze în amonte de codonul de pornire și conține elemente de reglare primare. Promotorul distal se găsește în amonte de promotorul proximal și conține elemente de reglare suplimentare. Promotorii bacterieni au două elemente de secvență scurtă în promotorii lor. TATAAT este secvența consens situată la -10 a promotorului bacterian, în timp ce TTGACA este secvența consens la -35. Sunt cunoscute ca -10 element și -35 element.
Care sunt asemănările dintre primer și promotor?
- Primer și promotor sunt două tipuri de secvențe ADN.
- Ele constau din secvențe de nucleotide.
- Atât primerul, cât și promotorul sunt importante pentru exprimarea genelor.
Care este diferența dintre primer și promotor?
Primer este o secvență scurtă de nucleotide concepută pentru amplificarea ADN-ului țintă. În contrast, promotorul este o secvență de ADN reglatoare specifică găsită în amonte de situsul de inițiere a transcripției al unei gene. Deci, aceasta este diferența cheie dintre primer și promotor. Primerii au aproximativ 20 de perechi de baze în timp ce promotorul poate avea 100-1000 de perechi de baze. Funcțional, primerii sunt serviți ca secvențe de pornire pentru sinteza noii catene, în timp ce promotorii controlează transcripția genelor prin furnizarea de situsuri de legare pentru ARN polimeraza și alți factori de transcripție.
În plus, un promotor este definit ca direcția transcripției și indică catena de sens a unei gene. Din punct de vedere structural, primerul este o secvență scurtă de ADN monocatenar, în timp ce promotorul este o secvență lungă de ADN dublu catenar.
Graficul informativ de mai jos prezintă mai multe comparații legate de diferența dintre primer și promotor.
Rezumat – Primer vs Promotor
Primerii sunt secvențe scurte de nucleotide complementare capetelor de flancare ale ADN-ului dublu catenar țintă. În PCR sunt utilizate două tipuri de primeri. Ele servesc ca secvențe de pornire pentru sinteza noilor catene. Primerii sunt proiectați comercial și sunt secvențe stabile la temperatură. Pe de altă parte, promotorul este o secvență reglatoare a unei gene situată în amonte de situsul de inițiere a transcripției. Promotorii controlează transcrierea genelor. Ele furnizează locuri de legare pentru ARN polimeraza și factori de transcripție pentru a iniția transcripția. Astfel, acesta este rezumatul diferenței dintre primer și promotor.
