Diferența cheie dintre cis și trans splicing este că cis splicing este un mecanism intramolecular care elimină intronii și unește exonii care se află în aceeași transcriere ARN, în timp ce trans-splicing-ul este un mecanism intermolecular care elimină intronii sau outronii și se unește cu exonii care nu se află în aceeași transcriere ARN.
Splicing-ul ARN este o formă de procesare a ARN-ului înainte de sinteza proteinelor. În acest proces, o transcriere de ARN pre-mesager nou făcută este transformată într-un ARN mesager matur. ARN-ul mesager matur ajută la producerea unei molecule de proteine. În timpul îmbinării ARN-ului, intronii (regiunile necodante) sunt îndepărtați, iar exonii (regiunile codificatoare) sunt uniți împreună pentru a face ARNm matur. Îmbinarea cis și trans sunt două tipuri de mecanisme de îmbinare a ARN.
Ce este Cis Splicing?
Cis splicing este un mecanism intramolecular care elimină intronii și unește exonii care se află în aceeași transcriere ARN. Îmbinarea cis normală procesează o singură moleculă de ARN. Splicing-ul cis este procesul tipic de splicing al pre ARNm realizat de spliceozomi. În intron, un loc donor (capătul 5’ al intronului), un loc de ramificare (lângă capătul 3’ al intronului) și un situs acceptor (capătul 3’ al intronului) sunt extrem de esențiale pentru îmbinare. Situl donor de îmbinare include o secvență invariantă GU la capătul 5’ al intronului. Situl acceptor de îmbinare de la capătul 3’ al intronului are o secvență AG invariantă. În amonte de secvența AG, există o regiune numită regiune pirimidină (tractul polipirimidinic). Mai în amonte de tractul polipirimidinic, există un punct de ramificare care include o nucleotidă de adenozină. Această nucleotidă este implicată în formarea lariatului.
Figura 01: Cis și Trans Splicing
Spliceozomii majori sunt U1, U2, U4, U5 și U6. Printre acestea, U1 și U2 sunt foarte importante. În cis splicing, U1 se leagă de locul de îmbinare 5’, iar U2 se leagă de punctul de ramificare din apropierea locului de îmbinare 3’. U5/U4/U6 leagă exonii la situsul 5’, cu U6 legându-se de U2. Mai târziu, U1 este lansat. U5 se schimbă de la exon la intron, iar U6 se leagă la locul de îmbinare 5’. În plus, U4 este, de asemenea, lansat. U6/U2 catalizează transesterificarea, făcând capătul 5’ al intronului să se lege la nucleotida A de pe intron. Acest lucru declanșează formarea lariatului. În formarea unui lariat, U5 leagă exonul la locul de îmbinare 3’, iar situsul 5’ este scindat. La faza finală a îmbinării, U2/U5/U6 rămân legate de lariat, iar locul 3’ este scindat. În plus, exonii sunt legați folosind hidroliza ATP în această fază.
Ce este Trans Splicing?
Trans splicing este un mecanism intermolecular care elimină intronii sau outronii și unește exonii care nu se află în aceeași transcriere ARN. În trans-splicing, nu există un loc de îmbinare 5’ pe molecula de pre ARNm pentru ca proteina U1 să se lege. În schimb, ARN-ul capped splice leader (SL) este trans-spliced pe secvența din outron.
Figura 02: Trans-splicing
Outron este o regiune a pre ARNm între capacul 5’ și site-ul de îmbinare trans. Cu toate acestea, proteina U2 se leagă de obicei la locul de îmbinare 3’. După îndepărtarea outronului, exonul lider de îmbinare (SL) este îmbinat cu primul exon de pe pre ARNm. În plus, trans-splicing-ul este un mecanism care se observă la anumite microorganisme, cum ar fi protistele din clasa Kinetoplastae, pentru a exprima gene.
Care sunt asemănările dintre Cis și Trans Splicing?
- Cis și trans splicing sunt două tipuri de mecanisme de splicing ARN.
- În ambele mecanisme, intronii sunt eliminați.
- De asemenea, în ambele mecanisme, exonii sunt uniți pentru a forma ARNm matur.
- Ambele mecanisme se găsesc la eucariote.
- Aceste mecanisme sunt absente la procariote.
Care este diferența dintre Cis și Trans Splicing?
Cis splicing este un mecanism intramolecular care elimină intronii și unește exonii care se află în aceeași transcriere ARN, în timp ce trans-splicing-ul este un mecanism intermolecular care elimină intronii sau outronii și unește exonii care nu se află în același ARN transcriere. Deci, aceasta este diferența cheie dintre cis și trans splicing. În plus, în splicing cis, intronii sunt îndepărtați pentru a forma ARNm matur. Pe de altă parte, în trans-splicing, intronii sau outronii sunt îndepărtați pentru a forma ARNm matur.
Următorul infografic listează diferențele dintre cis și trans splicing în formă tabelară pentru comparare una lângă alta.
Rezumat – Cis vs Trans Splicing
Splicing-ul ARN este o formă de procesare a ARN-ului înainte de procesul de sinteză a proteinelor. Splicing-ul cis și trans sunt două tipuri de mecanisme de splicing ARN care se găsesc la eucariote. Cis splicing este un mecanism intramolecular care îndepărtează intronii și unește exonii care se află în același transcript ARN, în timp ce trans-splicing este un mecanism intermolecular care elimină intronii sau outronii și unește exonii care nu se află în același transcript ARN. Astfel, aceasta încheie discuția despre diferența dintre cis și trans splicing.
