Diferența cheie – ADN-ul în amonte vs. în aval
Este important să aveți cunoștințe generale despre compoziția și structura ADN-ului pentru a înțelege diferența dintre ADN-ul din amonte și cel din aval. ADN-ul este compus din lanțuri de polinucleotide. Nucleotidele sunt blocurile de construcție care creează lanțuri de polinucleotide și fiecare nucleotidă este făcută din trei componente: un zahăr cu cinci atomi de carbon, o bază azotată și o grupare fosfat. O grupare fosfat și o grupare OH sunt atașate la carbonul în poziția 5’ și, respectiv, la carbonul în poziția 3’ a moleculei de zahăr într-o nucleotidă. Nucleotidele sunt unite între ele prin legături fosfodiester formate între gruparea fosfat 5’ a unei nucleotide și gruparea 3’ OH a nucleotidei adiacente. Dacă un lanț de polinucleotide are o grupare fosfat 5’ liberă, acesta este atribuit ca capăt 5’; dacă are un grup liber de 3’ OH, este atribuit ca un capăt de 3’. Prin urmare, catenele de ADN au de obicei capete 5’ și 3’ în funcție de pozițiile finale ale lanțurilor de polinucleotide. ADN-ul există și ca formă dublu catenară. Două fire sunt antiparalele unul față de celăl alt. Prin urmare, ADN-ul are două catene care merg în direcția 5’ până la 3’ și direcția 3’ până la 5’. ADN-ul în amonte și în aval este referit la transcripția și sinteza catenei de ARNm 5’ până la 3’. Dacă ADN-ul este considerat spre capătul 5 al catenei codificatoare de la locul de inițiere a transcripției, acesta este cunoscut ca ADN din amonte. Dacă ADN-ul este considerat spre capătul 3’ din catena codificatoare de la locul de inițiere a transcripției, este cunoscut ca ADN în aval. Aceasta este diferența cheie dintre ADN-ul din amonte și din aval.
Ce este ADN-ul din amonte?
O genă este o unitate de ereditate structurală și funcțională care este localizată pe ADN-ul unui organism. Este stocat cu instrucțiuni pentru a construi o proteină. Gena are o regiune specifică a unei molecule de ADN. Când este necesar, se transcrie și se traduce într-o proteină prin sinteza unei catene de ARNm. În mod normal, o catenă de codificare a genei merge din direcția 5’ la 3’. Când este transcris, produce o catenă de ARNm în aceeași direcție 5’ până la 3’. În timpul transcripției, catena antisens 3’ până la 5’ este servită ca șină șablon și inițiază sinteza ARNm. Există un situs de inițiere a transcripției în genă. Cu referire la locul de inițiere a transcripției, regiunea ADN-ului către capătul 5’ al catenei codificatoare este cunoscută ca ADN din amonte. Un promotor al genei este localizat în mod normal în regiunea din amonte a ADN-ului. În genele eucariote, există cutii TATA, elemente proximale promotoare și amplificatori în zona din amonte de genă. Regiunea din amonte a genei este referită cu numere negative. ADN-ul din amonte al unei gene este de cea mai mare importanță pentru transcriere.
Ce este ADN-ul în aval?
Locul de inițiere a transcripției este cunoscut ca punct +1 al unei gene. Regiunea ADN de la +1 punct spre capătul 3’ al catenei de codificare este cunoscută ca ADN în aval. Cu alte cuvinte, în aval de genă este de la locul de inițiere a transcripției către capătul 5’ al catenei șablon. Prin urmare, ADN-ul din aval al unei regiuni genice include unitatea transcripțională și alte secvențe, cum ar fi secvența terminator. Promotorul poate influența secvența în aval a unei gene. Partea din aval a unei gene este referită cu numere pozitive. ADN-ul din aval al unei gene este regiunea reală care dă produsul proteic.
Figura 01: ADN în amonte și în aval
Care este diferența dintre ADN-ul în amonte și în aval?
Amonte vs ADN-ul în aval |
|
| Regiunea ADN spre capătul 5’ al secvenței de codificare de la locul de inițiere a transcripției este cunoscută ca ADN în amonte. | Regiunea ADN spre capătul 3’ al catenei codificatoare de la site-ul de inițiere a transcripției este cunoscută ca ADN în aval. |
| Elemente | |
| Promotorii și potențiatorii se află în ADN-ul din amonte | Unitatea de transcripție și secvențele terminatoare sunt situate în ADN-ul din aval. |
| Numerotare | |
| Nucleotidele din regiunea din amonte sunt referite cu numere negative | Nucleotidele sunt referite cu numere pozitive. |
| Funcție | |
| Această regiune conține elemente necesare pentru reglarea și inițierea transcripției | Această regiune conține instrucțiuni pentru a produce o proteină și a termina transcripția |
Rezumat – ADN în amonte vs. în aval
Este ușor de identificat în amonte și în aval de o catenă de ARN. În ceea ce privește locul de referință, regiunea dinspre capătul 5’ al catenei de ARN este cunoscută ca ARN din amonte, în timp ce regiunea dinspre capătul 3’ este cunoscută ca ARN din aval. Cu toate acestea, în ADN, există două catene care rulează în ambele direcții 5’ până la 3’ și 3’ până la 5’. Prin urmare, diferența dintre ADN-ul din amonte și din aval este complicată. Prin urmare, se diferențiază cu referire la transcrierea unei gene. De la locul de inițiere a transcripției către capătul 5 al catenei de sens, regiunea ADN este cunoscută ca ADN din amonte, în timp ce de la locul de inițiere a transcripției către capătul 3’ al catenei de sens este cunoscută ca ADN din aval. Aceasta este diferența dintre amonte și aval de ADN.
