Diferența cheie – Proteomică vs Transcriptomics
Tehnologia omică este o tendință actuală, în care diferitele biomolecule ale unui organism sunt privite ca o întreagă colecție în ceea ce privește proprietățile și funcțiile sale. Tehnologia omică are o gamă largă de aplicații. Diferitele elemente omice ale unei probe biologice includ genomica, proteomica, transcriptomica și metabolomica. Proteomica implică studiul complet al tuturor proteinelor dintr-un organism viu. Este definită ca ansamblul tuturor proteinelor exprimate într-un organism, proprietățile sale structurale și funcționale. Prin urmare, setul complet de proteine formează proteomul. Transcriptomica este studiul complet al tuturor moleculelor de ARN mesager (ARNm) prezente într-un organism viu. Astfel, transcriptomica se ocupă de genele care sunt exprimate activ într-un organism viu. Setul total de ARNm dintr-un organism viu este denumit transcriptom. Diferența cheie dintre proteomică și transcriptomică se bazează pe tipul biomoleculei. În proteomică, se studiază setul total de proteine exprimate într-un organism viu, în timp ce, în transcriptomică, ARNm total al unui organism viu este studiat.
Ce este proteomica?
Termenul de proteomică a fost inventat în anul 1995 și a fost definit inițial ca complement proteic total dintr-o celulă, țesut sau organism. Odată cu progresul în studiile proteomice, a fost apoi modificat pentru a fi considerat un termen umbrelă în care au fost incluse multe domenii de studiu. În prezent, sub tema proteomică sunt studiate structura, orientarea, funcțiile, interacțiunile, modificările, aplicațiile și importanța proteinelor. Prin urmare, în prezent se desfășoară multe cercetări în domeniul proteomicii.
Primele studii proteomice au fost efectuate pentru a identifica conținutul de proteine din Escherichia coli. Maparea conținutului total de proteine a fost realizată folosind geluri bidimensionale (2D). După succesul acestui lucru, oamenii de știință au trecut la caracterizarea conținutului total de proteine la animale precum cobai și șoareci. În prezent, cartografierea proteinelor umane se face folosind electroforeză pe gel 2D.
Aplicații ale proteomicii
Există multe avantaje ale studiului proteomicii, deoarece proteinele sunt moleculele care guvernează cea mai mare parte a activității datorită proprietății de catalizator a proteinelor. Astfel, studiul proteinelor întregi poate oferi informații cu privire la starea de sănătate a unui organism. Unele aplicații sunt;
- Adnotarea genomului: prin studierea conținutului de proteine al unui organism, se pot determina genoamele exacte responsabile pentru compusul proteic activ. În acest scenariu, rezultatele din toate genomica, transcriptomica și proteomica sunt importante.
- Identificarea bolii / Diagnosticare: Proteomica este utilizată în identificarea stării bolii, prin compararea celor sănătoși cu cei bolnavi
- Pentru a efectua expresia proteinelor studiate în timpul experimentului.
- Modificări ale proteinelor și studii de interacțiune: Pentru a utiliza proteine în condiții in vitro sau și în condiții in vivo, pentru a decide condițiile de depozitare a acestor proteine extrase și pentru a studia comportamentul proteinei in vitro, in vivo și in – metode silico.
Figura 01: Proteomică
Există diferite tehnici implicate în proteomică
- Extracția proteinei totale și separarea proteinelor folosind electroforeza pe gel 2D. Proteinele pot fi separate și prin cromatografie lichidă de în altă performanță (HPLC).
- Secvențierea proteinelor extrase folosind metode precum metoda de secvențiere a lui Edmund sau spectrometria de masă.
- Odată ce secvențele sunt identificate, proprietățile structurale și funcționale ale conținutului de proteine sunt analizate folosind software-ul computerizat și instrumente bioinformatice.
Ce este transcriptomica?
Termenul transcriptom a fost inventat recent. Transcriptomica este studiul conținutului total de ARNm al unui organism. ARNm total este ADN-ul exprimat într-un organism viu sau într-o celulă. Colecția completă de ARNm este denumită transcriptom.
Pașii către analiza transcriptomului includ,
- Extracția ARN, separarea ARNm folosind cromatografia pe coloană pe gel cu perle poli DT.
- Secvențierea ARNm este finalizată.
Tehnologia Microarray este o modalitate obișnuită de a identifica transcriptomul unui organism. Tehnica microarray implică o placă sondă cu firele complementare ale transcriptomului. La hibridizare, ARNm prezent în organism sau celule poate fi caracterizat.
Figura 02: Tehnici transcriptomice
Transcriptomica este acum utilizată pe scară largă în domeniul medical. Diagnosticarea bolii și profilarea bolii sunt domeniile principale în care este utilizată transcriptomica. Prin analiza unui transcriptom al unui organism, ARNm străin poate fi identificat și, dacă există infecții, acesta poate fi identificat. ARN-ul necodant poate fi separat folosind tehnologii transcriptomice. Și, de asemenea, expresia genelor sub diferite stresuri de mediu poate fi monitorizată.
Care sunt asemănările dintre proteomică și transcriptomică?
- Ambele fac parte din conceptul de tehnologie omică.
- Ambele sunt folosite în diagnosticarea bolilor și caracterizarea bolii unui organism.
- Ambele domenii de studiu au implicat extracția biomoleculei, separarea biomoleculei și etapele de secvențiere.
Care este diferența dintre proteomică și transcriptomică?
Protemics vs Transcriptomics |
|
| Proteomica implică studiul complet al tuturor proteinelor dintr-un organism viu. | Transcriptomica este studiul complet al tuturor moleculelor de ARN mesager (ARNm) prezente într-un organism viu. |
| Tipul de biomoleculă studiat | |
| Proteinele sunt studiate în proteomică. | mARN sunt studiate în transcriptomică. |
| factori studiati | |
| Structura, funcția, interacțiunile, modificările și aplicațiile proteinelor sunt studiate în proteomică. | Structura secvenței, interacțiunile cu mediul și aplicațiile ARNm sunt studiate în transcriptomică. |
Rezumat – Proteomică vs Transcriptomics
Omics joacă un rol important în domeniul științelor vieții. Proteomica se referă la studiul proteomului care formează colecțiile complete de proteine într-o celulă sau un organism. Transcriptomica se referă la studiul transcriptomului, care este setul complet de ADN exprimat care este sub formă de ARNm. Cele două domenii de studiu, proteomica și transcriptomica, au fost derivate după introducerea genomicii și utilizate în prezent pe scară largă în diagnosticarea medicală și în caracterizarea și screeningul organismelor. Aceasta este diferența dintre proteomică și transcriptomică.
Descărcați PDF-ul Proteomics vs Transcriptomics
Puteți descărca versiunea PDF a acestui articol și să o utilizați în scopuri offline, conform nota de citare. Vă rugăm să descărcați versiunea PDF aici: Diferența dintre proteomică și transcriptomică
