Diferența cheie dintre proteomica țintită și nețintită este că proteomica țintită are ca scop măsurarea abundenței unei anumite proteine, în timp ce proteomica nețintită nu vizează o anumită proteină.
Proteomica este studiul pe scară largă al proteinelor, structurilor și funcțiilor acestora. Studiază întregul complement proteic dintr-o celulă, țesut sau organism în condiții specifice. Există două tipuri de proteomică ca proteomică țintită și proteomică nețintă.
Ce este proteomica vizată?
Așa cum indică numele, proteomica țintită vizează o anumită proteină sau o peptidă dintr-un amestec complex de proteine pentru analiză. Apoi analizează prezența și cantitatea acelei proteine specifice preselectate. Această metodă este posibilă doar pentru o probă sau pentru mai multe eșantioane. Această metodă este potrivită chiar și pentru un anumit grup de proteine. Rezultă date mai precise, cantitative și sensibile. Mai mult, spectrometria de masă cuplată cu proteomica țintită produce măsurători mai precise și fiabile. Această metodă utilizează spectrometrul de masă triplu cvadrupol (QQQ) pentru analiza sa.
Figura 01: Proteomics
Proteomica țintită este o metodă potrivită dacă doriți să verificați dacă o țintă knockdown este efectiv doborâtă sau când doriți să cuantificați o anumită proteină/peptidă în serul sanguin, lichidul cerebral sau în lizat de celule etc. De asemenea, puteți utilizați-l dacă doriți să verificați dacă o anumită proteină este exprimată diferențial în probe sau în timpul unui experiment de curs în timp.
Ce este proteomica nedirecționată?
Proteomica nețintită, așa cum menționează și numele, nu vizează o anumită proteină sau peptidă pentru analiza sa. Proteomica de descoperire este un alt nume pentru proteomica nețintită. De fapt, este o analiză mai „globală”. În general, efectuarea de proteomice nețintite este de a răspunde la întrebarea „ce proteină sau proteine sunt în această probă sau mai multe probe?”. Această metodă nu este sensibilă ca proteomică țintită. Dar poate identifica și măsura multe proteine, inclusiv proteine noi. Proteomica nețintă poate produce atât măsurători cantitative, cât și calitative.
Care sunt asemănările dintre proteomica vizată și cea nedirecționată?
- Atât proteomica țintită, cât și cea nedirecționată măsoară proteinele din probe.
- Sunt importante în analiza proteomului.
- Aceste metode folosesc spectrometria de masă.
Care este diferența dintre proteomica vizată și cea nedirecționată?
În primul rând, proteomica țintită este determinarea prezenței și cantității unei anumite proteine sau peptide într-un amestec complex de proteine. În schimb, proteomica nețintă este studiul cantitativ și calitativ al proteinelor prezente într-o probă sau probe fără a viza o anumită proteină. Proteomica țintită este efectuată cu proteine preselectate sau țintite, în timp ce proteomica țintită este efectuată pentru a afla tipurile de proteine din această probă. În plus, proteomica țintită este mai sensibilă decât proteomica nețintă.
Rezumat – Proteomică direcționată versus nedirecționată
Pentru a rezuma, proteomica țintită și nețintită sunt două tipuri de studii de proteine. După cum sugerează numele lor, proteomica vizată vizează o proteină specifică, în timp ce proteomica nețintită nu vizează o proteină specifică. Aceasta este diferența dintre proteomica țintită și ne-țintită.
