Diferența cheie dintre dNTP și ddNTP este că dNTP sau deoxiribonucleotidele sunt blocurile de construcție ale ADN-ului și au o grupă 3ʹ-OH pe structura zahărului pentozei, în timp ce ddNTP sau trifosfații dideoxinucleozidici sunt nucleotide cărora le lipsește grupa 3ʹ-OH și acestea sunt utilizate în tehnica de secvențiere a ADN-ului Sanger dideoxi pentru a produce secvențe de ADN de lungimi diferite.
dNTP și ddNTP sunt nucleotide. dNTP se referă la nucleotide de deoxiriboză. Ele sunt elementele de bază ale ADN-ului. dNTP-urile sunt folosite pentru a sintetiza ADN. dNTP, pe de altă parte, se referă la trifosfații dideoxinucleozidici. Ele sunt utilizate în secvențierea Sanger pentru a termina sinteza ADN-ului la lungimi diferite. Le lipsește grupul OH la poziția 3′. Un hidrogen este prezent în poziția 3ʹ în loc de grupa OH. Prin urmare, ddNTP-urile nu sunt capabile să formeze o legătură fosfodiester cu următoarea nucleotidă. dNTP este capabil să realizeze sinteza ADN-ului, în timp ce ddNTP este capabil să încheie polimerizarea ADN-ului.
Ce este dNTP?
dNTP înseamnă nucleotidă dezoxiriboză sau dezoxiribonucleotidă. Este elementul de bază al ADN-ului. Există patru tipuri de dNTP. Acestea sunt dATP, dTTP, dCTP și dGTP. Ele sunt denumite după bazele azotate purinice sau pirimidinice: Adenina (A), Guanina (G), Timina (T) și Citozina (C).
Figura 01: dNTP
Adenina și guanina sunt baze purinice, în timp ce timina și citozina sunt baze pirimidinice. Zahărul pentoză al dNTP este dezoxiriboză. Există și o grupare fosfat. Prin urmare, dNTP este compus din trei componente: o bază azotată, zahăr dezoxiriboză și o grupare fosfat. Aceste dNTP-uri se combină între ele prin legături fosfodiester. În dNTP, există o grupare OH atașată la poziția 3′ a zahărului pentoză, care este necesară pentru a forma o legătură cu gruparea fosfat atașată la carbonul 5′ al zahărului următoarei nucleotide. Deoarece toate dNTP-urile au această grupă 3ʹ -OH, ele sunt capabile să sintetizeze și să extindă catenele de ADN. Prin urmare, dNTP acționează ca unitatea de bază repetată a ADN-ului și a materiei chimice a genelor. Sinteza ADN-ului continuă întotdeauna de la 5ʹ la 3ʹ.
Ce este DdNTP?
Secvențierea Sanger este o metodă de secvențiere a ADN-ului de prima generație dezvoltată de Frederick Sanger și colegiile sale în 1977. Este cunoscută și sub denumirea de Secvențiere a Terminării Lanțului sau Secvențiere Dideoxi, deoarece principiul de bază al acestei metode este terminarea lanțului folosind trifosfați de dideoxinucleozide. (ddNTP-uri). ddNTP-urile sunt nucleotide utilizate în secvențierea Sanger. Secvențierea Sanger se bazează pe încorporarea selectivă a ddNTP-urilor și terminarea sintezei ADN-ului în timpul replicării ADN in vitro. Specialitatea ddNTP-urilor este că le lipsește gruparea 3ʹ-OH de pe zahărul pentoză pentru a continua formarea legăturii fosfodiester între grupul fosfat de 5ʹ din nucleotidele adiacente. Prin urmare, odată ce un ddNTP este atașat de firul de extindere, alungirea lanțului încetează și se termină din acel punct. ddNTPs acționează ca inhibitori de alungire a lanțului ai ADN polimerazei în timpul metodei de secvențiere Sanger.
Figura 02: ddNTP
Există patru ddNTP-uri: ddATP, ddCTP, ddGTP și ddTTP utilizate în secvențierea Sanger. Aceste nucleotide opresc procesul de replicare a ADN-ului atunci când sunt încorporate în catena de ADN în creștere. Ca rezultat, secvențierea Sanger produce lungimi diferite de ADN scurt. Electroforeza pe gel capilar este utilizată pentru a organiza aceste catene scurte de ADN după dimensiunile lor pe un gel. ddNTP-urile sunt marcate radioactiv sau fluorescent cu culori diferite pentru a ușura analiza secvenței ADN. Prin analiza gelului, poate fi determinată secvența de nucleotide a catenei de ADN necunoscută.
Care sunt asemănările dintre dNTP și DdNTP?
- Atât dNTP, cât și ddNTP sunt folosite în secvențierea Sanger.
- Există patru tipuri de dNTP-uri și ddNTP-uri.
- Sunt compuse din trei componente: o bază azotată, zahăr dezoxiriboză și grupări fosfat.
Care este diferența dintre dNTP și DdNTP?
dNTP este unul dintre cele patru tipuri de dezoxiribonucleotide care sunt blocuri de bază ale ADN-ului. ddNTP este unul dintre cele patru tipuri de trifosfați dideoxiribonucleozidici utilizate în tehnica de secvențiere Sanger. dNTP are o grupă 3ʹ-OH pe zahărul pentoză, în timp ce ddNTP nu are gruparea 3ʹ-OH pe zahărul pentoză. Astfel, aceasta este diferența cheie dintre dNTP și ddNTP. Mai mult, dNTP-urile efectuează polimerizarea ADN-ului, în timp ce ddNTP-urile termină polimerizarea ADN-ului. Prin urmare, aceasta este o altă diferență majoră între dNTP și ddNTP.
Infografia de mai jos enumeră diferențele dintre dNTP și ddNTP sub formă tabelară.
Rezumat – dNTP vs DdNTP
dNTP-urile normale sunt blocuri ale ADN-ului, în timp ce ddNTP-urile sunt nucleotide utilizate în tehnica de secvențiere Sanger. dNTP are 3ʹ-OH în timp ce ddNTP nu are 3ʹ-OH. Astfel, aceasta este diferența cheie dintre dNTP și ddNTP. Mai mult, dNTP poate sintetiza o catenă de ADN, în timp ce ddNTP poate opri polimerizarea ADN-ului. Prin urmare, ddNTP-urile sunt utilizate în secvențierea Sanger pentru a produce diferite catene de ADN cu lungimi diferite. În timpul secvențierii Sanger, sunt incluse atât dNTP, cât și ddNTP.
