Diferența cheie dintre NGS și WGS este că secvențierea de generație următoare (NGS) este o tehnologie de secvențiere de a doua generație masiv paralelă, care are un randament ridicat, un cost scăzut și rapid, în timp ce secvențierea întregului genom (WGS) este o metodă cuprinzătoare de analiză a întregului ADN genomic al unei celule în același timp, folosind tehnici de secvențiere, cum ar fi secvențierea Sanger, abordarea cu pușcă sau secvențierea NGS de mare capacitate.
În ultimele decenii, înțelegerea genomului oamenilor și al altor animale a crescut masiv datorită descoperirii tehnicilor de secvențiere rapidă și a instrumentelor bioinformatice. Tehnicile convenționale de secvențiere, cum ar fi secvențierea Sanger, au avut limitările lor, ceea ce a cerut dezvoltarea de noi metode de secvențiere rapidă, cum ar fi secvențierea de generație următoare (NGS) și secvențierea nanoporilor. Tehnica de secvențiere a întregului genom (WGS) este o abordare recentă care este deja utilizată în multe proiecte de cercetare genomică, cum ar fi proiectul genomic 100.000 de Genomic England, Marea Britanie. Deci, NGS și WGS sunt două metode de secvențiere care sunt în prezent încorporate în multe proiecte genomice.
Ce este NGS?
NGS (secvențierea de generația următoare) este o tehnologie de secvențiere din a doua generație masiv paralelă, care are un randament ridicat, costuri reduse și rapidă. Nu există o definiție precisă pentru secvențierea de generație următoare. Dar îl putem distinge clar de tehnicile convenționale de secvențiere bazate pe capilare. Secvențierea de generație următoare permite secvențierea unei molecule de ADN cu o dimensiune totală mai mare de 1 milion de perechi de baze într-un singur experiment. Oferă viteză fără precedent și opțiuni de debit ridicat, cum ar fi permiterea secvențialării ADN-ului mai multor indivizi în același timp. Acest lucru se realizează prin miniaturizarea volumului reacțiilor individuale de secvențiere. Mai mult, acest lucru limitează și dimensiunea instrumentelor și minimizează costul reactivilor pe reacție.
Figura 01: Platforme NGS
NGS este o metodă de secvențiere cu citire scurtă care a revoluționat deja domeniul cercetării biologice. În plus, NGS este aplicat în diverse domenii, cum ar fi secvențierea de novo a genomului, secvențierea întregului genom, analiza transcriptomului, secvențierea ARN mic și micro ARN, resecvențierea țintită și secvențierea întregului exom.
Ce este WGS?
WGS (secvențierea întregului genom) este o metodă cuprinzătoare de analiză a întregului ADN genomic al unei celule la un moment dat, folosind tehnici de secvențiere, cum ar fi secvențierea Sanger, abordarea cu pușcă sau secvențierea NGS de mare capacitate. Este, de asemenea, cunoscut sub numele de secvențiere completă a genomului sau secvențiere completă a genomului. Secvențierea întregului genom implică secvențierea întregului ADN cromozomial al unui organism, precum și a ADN-ului din mitocondrii, iar pentru plante, ADN-ul din cloroplastă la un moment dat. WGS le permite oamenilor de știință să citească secvența exactă a tuturor literelor care alcătuiesc setul complet de ADN. Se așteaptă ca WGS folosind platforma NGS să revoluționeze configurația clinică.
Figura 02: WGS vs secvențierea ierarhică a puștilor
Secvențierea întregului genom a fost introdusă în îngrijirea clinică în 2014. În plus, aplicarea WGS implică secvențierea genelor la nivel SNP pentru a identifica variante funcționale în studii de asociere, intervenție terapeutică în medicina personalizată, biologie evolutivă, analiză genomică comparativă, studii de mutații și rearanjamente, studii de asociere cu variante rare și de predicție a susceptibilității bolii și a răspunsului la medicamente.
Care sunt asemănările dintre NGS și WGS?
- NGS și WGS sunt două tehnici de secvențiere.
- Ambele tehnici fie secvenționează ADN, fie ARN.
- Aceste tehnici sunt noi și de încredere.
- Ambele sunt folosite în diagnosticarea bolilor și în descoperirea medicamentelor.
Care este diferența dintre NGS și WGS?
NGS este o tehnologie de secvențiere masiv paralelă de a doua generație, care are un randament ridicat, un cost scăzut și rapid, în timp ce WGS este o metodă cuprinzătoare de analiză a întregului ADN genomic al unei celule la un moment dat, folosind tehnici de secvențiere precum ca secvențiere Sanger, apropiere cu pușcă sau secvențiere NGS de mare capacitate. Deci, aceasta este diferența cheie dintre NGS și WGS. În plus, NGS constă numai din metode de secvențiere de a doua generație, în timp ce WGS constă din metode de secvențiere din prima, a doua și a treia generație.
Următorul tabel prezintă diferențele dintre și NGS și WGS în formă tabelară pentru comparație una lângă alta.
Rezumat – NGS vs WGS
În ultimele decenii, diferite tehnici de secvențiere au fost aplicate în mod obișnuit în cercetarea moleculară contemporană. Și chiar și acestea sunt instrumente foarte puternice pentru multe aplicații clinice. NGS și WGS sunt două metode de secvențiere care se încorporează în prezent în multe proiecte genomice. NGS este o tehnologie de secvențiere de a doua generație, care are un randament ridicat, un cost scăzut și rapid. Pe de altă parte, WGS este o metodă de analiză a întregului ADN genomic sau a întregului ADN genomic al unei celule la un moment dat, folosind tehnici de secvențiere, cum ar fi secvențierea Sanger, abordarea cu pușcă sau secvențierea NGS de mare capacitate. Deci, acesta este rezumatul diferenței dintre NGS și WGS.
