Diferența cheie dintre ITS1 și ITS2 este că ITS1 este un ADN distanțător situat între genele ARNr 18S și 5.8S la eucariote, în timp ce ITS2 este un ADN distanțator situat între genele ARNr 5.8S și 28S la eucariote.
Distanțierul transcris intern (ITS) este ADN-ul distanțier situat de obicei între subunitatea mică de ARN ribozomal și genele subunității mari de ARN ribozomal din cromozom sau în regiunea transcrisă corespunzătoare din molecula de transcriere a precursorului de ARNr policistronic. În bacterii și arhee, există doar un singur ITS între genele ARNr 16S și 23S. Dar la eucariote, există două ADN distanțier ITS: ITS1 (între 18S și 5.genele ARNr 8S) și ITS2 (între ARNr 5,8S și 28S). Prin urmare, ITS1 și ITS2 sunt două ADN-uri distanțare găsite între genele ARNr la eucariote.
Ce este ITS1?
ITS1 este un ADN distanțier situat între genele ARNr 18S și 5.8S la eucariote. ITS se referă la o bucată de ADN distanțier nefuncțional situat între genele ARNr. ITS1 are o variație de lungime mai mare decât ITS2. Variația lungimii ITS1 este de aproximativ (200-300bp). Markerii ITS, cum ar fi ITS1, și-au dovedit eficiența în elucidarea relațiilor filogenetice dintre diferiți taxoni. Mai mult, ADN-ul distanțier ITS1 este mai puțin conservat decât ADN-ul distanțier ITS2. Structurile ITS1 sunt conservate doar în unități taxonomice mult mai mici. Fiecare grup ribozomal eucariote conține, de asemenea, regiuni numite distanțieri transcriși externi (5’ și 3’ ETS).
Figura 01: Regiunea ITS1
ADN-ul distanțier ITS1 este foarte aproape de distanțierul transcris extern de 5’ (5’ ETS). În plus, dacă cineva dorește să amplifice regiunea ITS1 pentru studii de relație filogenetică, trebuie să folosească o pereche de primeri specifică (primeri inversi și directe) în acest scop. Pentru a amplifica regiunea ITS1, două seturi de primeri sunt utilizate în mod normal în protocoalele PCR ale laboratoarelor. Acestea sunt ITS1 înainte și ITS2 înapoi sau ITS1 înainte și ITS4 înapoi.
Ce este ITS2?
ITS2 este un ADN distanțier situat între genele ARNr 5.8S și 28S la eucariote. Regiunea ITS2 are o variație de lungime mai scurtă decât regiunea ITS1. Variația lungimii ITS2 este de aproximativ (180-240bp). Cu toate acestea, regiunea ITS2 este mai conservată decât regiunea ITS1 în multe unități taxonomice. Acesta identifică că toate secvențele ITS2 au un nucleu comun al structurii secundare. Mai mult, 40% din regiunea ITS2 este conservată printre toate angiospermele, în timp ce este posibil să se alinieze 50% din regiunea ITS2 la nivelul familiei și la nivel superior.
Figura 02: Regiunea ITS2
Indiferent de domeniul de conservare, utilizarea regiunii ITS2 este, de asemenea, foarte populară, cum ar fi regiunea ITS1, în studiile relațiilor filogenetice, în special în codurile de bare ale ADN-ului fungic. Pentru a amplifica regiunea ITS2, un set de primeri specific este, în general, utilizat în protocoalele PCR ale laboratoarelor. Acesta este ITS1 înainte și ITS4 invers. Dar când protocolul PCR utilizează acest set de primeri, el amplifică și regiunea ITS1 împreună cu regiunea ITS2. În plus, ADN-ul distanțier ITS2 este foarte aproape de distanțierul transcris extern de 3’ (ETS de 3’).
Asemănări între ITS1 și ITS2
- ITS1 și ITS2 sunt doi ADN distanțier situat între genele ARNr.
- Sunt prezente numai la eucariote.
- Ambele pot fi amplificate folosind anumite perechi de primeri.
- Ambele sunt excizate la maturarea ARNr ca produse secundare nefuncționale.
- Ambele sunt foarte importante pentru studiile relațiilor filogenetice, în special în codurile de bare ale ADN-ului fungic.
Diferența dintre ITS1 și ITS2
ITS1 este un ADN distanțier prezent între genele ARNr 18S și 5.8S la eucariote, în timp ce ITS2 este un ADN distanțator situat între genele ARNr 5.8S și 28S la eucariote. Deci, aceasta este diferența cheie dintre ITS1 și ITS2. În plus, ITS1 are o variație mai mare a lungimii în comparație cu ITS2. Pe de altă parte, ITS2 are o variație de lungime mai scurtă în comparație cu ITS1. Aceasta este o altă diferență între ITS1 și ITS2.
Infograficul de mai jos enumeră diferențele dintre ITS1 și ITS2 în formă tabelară pentru comparare una lângă alta.
Rezumat – ITS1 vs ITS2
Regiunea internă transcrisă (ITS) este o bucată nefuncțională de ADN distanțier situat între genele ARNr. În bacterii și arhee, există doar o singură regiune ITS. Dar la eucariote, există două regiuni ITS: ITS1 și ITS2. ITS1 este un ADN spacer care este situat între genele ARNr 18S și 5.8S la eucariote, în timp ce ITS2 este un ADN spacer care este situat între genele ARNr 5.8S și 28S la eucariote. Astfel, acesta este rezumatul diferenței dintre ITS1 și ITS2.
