Diferența cheie dintre FISH și CGH este că FISH este o tehnică moleculară care detectează o secvență specifică de ADN pe un cromozom folosind sonde marcate fluorescent, în timp ce CGH este o altă tehnică citogenetică moleculară care detectează modificări ale ADN-ului genomic..
Analiza citogenetică joacă un rol important în medicină atunci când detectează anomalii cromozomiale, cum ar fi aneuploidii, ștergeri, duplicări și rearanjamente etc. Anomaliile cromozomiale duc în cele din urmă la boli genetice precum cancerul, infertilitatea, sindromul Down, sindromul Klinefelter, Turner. sindrom, leucemie, etc. Există diferite metode citogenetice moleculare pentru a detecta defectele și bolile menționate mai sus. Printre acestea, FISH (hibridare fluorescentă in situ) și CGH (hibridare genomică comparativă) sunt două tehnici de hibridizare puternice. Cu toate acestea, ambele metode au argumente pro și contra.
Ce este FISH?
FISH este o tehnică de hibridizare a acidului nucleic efectuată pe o porțiune sau secțiune de țesut, în întregul țesut sau celule. Este o metodă bazată pe sonde. Tehnica depinde de teoria împerecherii bazelor complementare Watson Crick, rezultând fie hibrizi ADN – ADN, fie hibrizi ADN – ARN, care pot detecta astfel genele mutante sau pot identifica gena de interes. În plus, această tehnică utilizează secvențe de ADN monocatenar, secvențe de ADN dublu catenar, secvențe de ARN monocatenar sau oligonucleotide sintetice preparate folosind translația porniturii ca sonde care sunt complementare cu secvențele de gene de interes. În plus, cea mai importantă caracteristică a acestei tehnici este marcarea sondelor cu coloranți fluorescenți. Astfel, sondele se leagă de părțile complementare ale cromozomului și îl fac ușor de detectat.
În plus, FISH este o metodă foarte sensibilă și specifică. Prin urmare, este o tehnică comună atât în cercetarea, cât și în diagnosticarea malignităților hematologice și a tumorilor solide. Dar, FISH arată rezoluție scăzută. De asemenea, necesită cunoștințe prealabile despre anomalia țintă pentru a proiecta secvențe de sondă.
Figura 01: FISH
Există multe aplicații ale FISH, în principal în diagnosticarea moleculară a bolilor infecțioase pentru a identifica prezența agenților patogeni și pentru a confirma agentul patogen prin diagnosticare moleculară. Mai mult decât atât, FISH este o tehnică frecvent utilizată în domeniile biologiei dezvoltării, cariotipării și analizei filogenetice și cartografierii fizice a cromozomilor.
Ce este CGH?
Hbridizarea genomică comparativă (CGH) este o altă tehnică citogenetică moleculară bazată pe ADN, care poate detecta modificările secvențelor de ADN genomic. Metoda este o metodă avansată care poate analiza modificările cromozomilor și ale genelor pentru a detecta modificările sau modificările secvențelor ADN genomic. În plus, CGH necesită izolarea și fragmentarea ADN-ului din proba experimentală și proba de referință. Apoi, probele trebuie etichetate folosind doi coloranți fluorescenți diferiți (de obicei roșu și verde). Mai târziu, ambele probe sunt amestecate și permise pentru hibridizare competitivă. Pasul final este analiza probelor pentru modificări ale ADN-ului, cum ar fi duplicarea genelor, pierderea genelor etc. În special, măsoară diferențele dintre numărul de copii ale ADN dintre proba de testat și proba de control.
Figura 02: CGH
O altă versiune de CGH este disponibilă acum; este o metodă mai avansată decât CGH normală. Este o tehnică numită CGH bazată pe matrice sau aCGH. aCGH permite identificarea precisă a delețiilor de gene sau secvențe în multe mii de secvențe într-un singur experiment.
Care sunt asemănările dintre FISH și CGH?
- FISH și CGH sunt două tehnici moleculare.
- Atât FISH, cât și CGH se bazează pe hibridizarea acidului nucleic.
- De asemenea, ambele tehnici au nevoie de sonde proiectate pentru a detecta anumite ținte ADN.
- Le folosim pentru diagnosticarea pre-natală și post-natală a bolilor genetice.
- În plus, atât FISH, cât și CGH sunt instrumente foarte puternice pentru a studia modificările genomice.
- Ei folosesc coloranți fluorescenți pentru a marca sondele.
Care este diferența dintre FISH și CGH?
FISH este o procedură de hibridizare in situ care utilizează sonde fluorescente pentru a detecta secvențe specifice de ADN, în timp ce CGH este o tehnică de hibridizare moleculară care detectează modificările secvențelor de ADN genomic. Deci, aceasta este diferența cheie dintre FISH și CGH.
În plus, FISH necesită cunoștințe prealabile despre anomalia țintă pentru a proiecta secvențele sondei, în timp ce CGH nu necesită cunoștințe anterioare. De asemenea, o altă diferență între FISH și CGH este că FISH arată rezoluție limitată, în timp ce aCGH arată rezoluție în altă.
Infografia de mai jos rezumă diferența dintre FISH și CGH.
Rezumat – FISH vs CGH
FISH și CGH sunt două tehnici citogenetice moleculare care facilitează detectarea secvențelor de gene de interes. FISH facilitează detectarea secvenței specifice de ADN pe un cromozom folosind sonde marcate fluorescent, în timp ce CGH facilitează detectarea modificărilor ADN-ului genomic. Deci, aceasta este diferența cheie dintre FISH și CGH.
