Diferența cheie dintre CGH și CGH matrice este că CGH este o metodă citogenetică moleculară tradițională pentru analizarea variației numărului de copii în ADN-ul unei probe de testat care are o rezoluție mai mică, în timp ce CGH matrice este o metodă citogenetică moleculară complet automatizată pentru se analizează variația numărului de copii din ADN-ul unui eșantion de testat care are o rezoluție mai mare.
CGH și matricea CGH sunt două tehnici de detectare a variațiilor numărului de copii la indivizi. Variația numărului de copii se referă la secțiunile genomului care sunt repetate. Numărul de copii variază între persoane. Variația numărului de copii este, în general, clasificată în două grupuri: repetări scurte și repetări lungi. Unul dintre cele mai cunoscute exemple pentru o variație scurtă a numărului de copii este repetarea trinucleotidei CAG în gena huntingtin. Aceasta provoacă o tulburare neurologică numită huntingtin. Cel mai bun exemplu pentru variația numărului de copii repetate lungi este gena alfa amilază, care provoacă rezistență la insulină. Variația numărului de copii poate fi detectată prin tehnici precum FISH, CGH și matrice CGH.
Ce este CGH?
CGH este o metodă citogenetică moleculară tradițională pentru analizarea variației numărului de copii în ADN-ul unei probe de testat în comparație cu o probă de referință. Are o rezoluție mai mică în comparație cu tehnicile automate. Obiectivul acestei tehnici este de a compara rapid și eficient două mostre de ADN genomic care provin din surse diferite.
Figura 01: CGH
Procedura implică izolarea ADN-ului din două surse: test și referință. Apoi, următorul pas este etichetarea independentă a probelor de ADN de testare și de referință cu fluorofori de diferite culori. Ulterior, cele două probe de ADN au fost denaturate pentru a obține probele de ADN monocatenar. În cele din urmă, a fost realizată hibridizarea celor două probe de ADN rezultate într-un raport de 1:1 la o răspândire normală în metafază a cromozomilor. Diferențele cromozomiale pot fi identificate între cele două surse folosind un microscop cu fluorescență și un software de calculator. În plus, tehnica CGH este capabilă să detecteze doar anomalii cromozomiale dezechilibrate.
Ce este Array CGH?
Array CGH este o metodă citogenetică moleculară complet automatizată pentru analizarea variației numărului de copii din ADN-ul unei probe de testare în comparație cu o probă de referință. Are o rezoluție mai mare și a fost dezvoltat pentru a minimiza limitările CGH tradiționale. Array CGH combină principiile CGH cu utilizarea micromatricelor. În loc să utilizeze răspândirea cromozomilor în metafază, această metodă folosește diapozitive aranjate cu segmente mici de ADN ca ținte. Aceste micromatrice au fost realizate prin depunerea și imobilizarea unei cantități mici de ADN (sonde) pe un suport solid de sticlă. Dimensiunea sondelor poate varia de la oligonucleotidă la un cromozom artificial bacterian.
Figura 02: Matrice CGH
Indiferent de sonde, metoda de bază a matricei CGH este similară cu CGH. Odată ce sondele care conțin microarray sunt pregătite, cele două probe de ADN (test și referință) marcate cu fluorofori de culori diferite sunt amestecate împreună și adăugate la microarray. Deoarece ADN-ul din probe este monocatenar din cauza denaturarii, acest ADN hibridizează cu sonde monocatenar aranjate. Folosind un sistem de imagistică digitală, este posibilă identificarea diferențelor cromozomiale dintre cele două surse.
Care sunt asemănările dintre CGH și Array CGH?
- CGH și matricea CGH sunt două tehnici de detectare a variațiilor numărului de copii.
- Sunt metode citogenetice moleculare.
- Ambele metode diagnostichează anomaliile cromozomiale dezechilibrate.
- Fluoroforii sunt implicați în ambele metode.
- Ambele metode pot fi folosite pentru a detecta tulburările genetice din cauza variațiilor numărului de copii.
- Sunt utilizate pe scară largă în analiza genomică comparativă.
Care este diferența dintre CGH și Array CGH?
CGH este o metodă citogenetică moleculară tradițională pentru analizarea variației numărului de copii din ADN-ul unei probe de testat, care are o rezoluție mai mică, în timp ce array CGH este o metodă citogenetică moleculară complet automatizată pentru analiza variației numărului de copii din ADN-ul unei probe de testat care are o rezoluție mai mare. Deci, aceasta este diferența cheie dintre CGH și matrice CGH. În plus, în CGH, probele de ADN de test și de referință hibridizează cu o răspândire normală în metafază a cromozomilor, dar în matrice CGH, probele de ADN de testare și de referință hibridizează cu sondele de ADN imobilizate care conțin microarray.
Infograficul de mai jos enumeră diferențele dintre CGH și matricea CGH sub formă tabelară pentru comparație alăturată.
Rezumat – CGH vs Array CGH
CGH și array CGH sunt două tehnici citogenetice moleculare pentru a detecta anomaliile cromozomiale dezechilibrate. Ele sunt utilizate pe scară largă în analiza genomică comparativă. CGH este o metodă citogenetică moleculară tradițională pentru analiza variației numărului de copii în ADN-ul unei probe de testare care are o rezoluție mai mică. În schimb, matricea CGH este o metodă citogenetică moleculară complet automatizată pentru analiza variației numărului de copii în ADN-ul unei probe de testare care are o rezoluție mai mare. Astfel, aceasta rezumă diferența dintre CGH și matrice CGH.
