Diferența cheie dintre andocarea moleculară și scoring este că andocarea este o tehnică utilizată pentru a determina afinitatea de legare între două molecule, în timp ce scoringul este un proces de evaluare a unei anumite poziții prin numărarea numărului de interacțiuni intermoleculare favorabile.
Termenii de andocare moleculară și scoring sunt folosiți în domeniul modelării moleculare. Modelarea moleculară este o tehnică utilizată pentru a determina aranjamentele posibile ale diferitelor molecule într-o anumită substanță. Această tehnică este importantă în crearea de noi compuși stabili.
Ce este andocarea moleculară?
Andocarea moleculară este o simulare computațională a legării unui ligand candidat la un receptor. Această metodă prezice orientarea preferată a unei molecule către o altă moleculă atunci când este legată una de ceal altă pentru a forma un complex stabil. Rezultatele obținute din această tehnică pot fi utilizate pentru a prezice puterea de asociere sau afinitatea de legare între două molecule. Aici, funcția de scor molecular este de asemenea importantă.
Figura 01: O diagramă simplă care arată procesul interacțiunilor moleculare în sistemele biologice
În general, această tehnică ia în considerare moleculele relevante din punct de vedere biologic, cum ar fi proteinele, peptidele, acizii nucleici, carbohidrații și lipidele. Aceste molecule sunt foarte importante și joacă un rol important în mecanismele de transducție a semnalului din corpul nostru. Prin urmare, orientarea celor două molecule care se vor lega pentru acest proces de transducție a semnalului afectează tipul de semnal produs aici. Asta inseamna; andocarea moleculară este importantă în determinarea atât a puterii, cât și a tipului de semnal produs în timpul transducției semnalului în sistemele biologice.
În plus, tehnicile de andocare moleculară sunt importante în proiectarea medicamentelor bazate pe structură. Aceasta se datorează predictibilității conformației de legare a moleculelor mici, cum ar fi liganzii, la un situs de legare adecvat.
Ce este scorul molecular?
Scorajul molecular este un tip de funcție matematică care este utilă în evaluarea progresului andocării moleculare. În domeniul chimiei computaționale, funcțiile de scoring sunt utilizate pentru prezicerea afinității de legare între două molecule după procesul de andocare. De exemplu, dacă avem o moleculă mică dintr-un medicament cu particule și există o țintă biologică, cum ar fi o proteină, putem evalua afinitatea medicamentului față de locul de legare. Mai mult, scorul molecular poate fi utilizat pentru a prezice interacțiunile intermoleculare dintre două proteine sau dintre o proteină și moleculele de ADN.
Figura 02: Funcția de notare pe scurt
Aplicația majoră a punctajului molecular este în procesele de proiectare a medicamentelor - de exemplu, screening virtual, proiectare de novo, optimizare a clienților potențiali etc.
Care este diferența dintre andocarea moleculară și scoring?
Andocarea moleculară și scorul sunt importante în modelarea moleculară. Diferența cheie dintre andocarea moleculară și scoring este că andocarea este o tehnică folosită pentru a determina afinitatea de legare între două molecule, în timp ce scoring este un proces de evaluare a unei anumite poziții prin numărarea numărului de interacțiuni intermoleculare favorabile..
Următorul infografic rezumă diferența dintre andocarea moleculară și notare.
Rezumat – Andocare moleculară vs scoring
Andocarea moleculară și scorul sunt importante în modelarea moleculară. Diferența cheie dintre andocarea moleculară și scoring este că andocarea este o tehnică folosită pentru a determina afinitatea de legare între două molecule, în timp ce scoring este un proces de evaluare a unei anumite poziții prin numărarea numărului de interacțiuni intermoleculare favorabile..
