Diferența cheie dintre linker și adaptor este că un linker nu are capete coezive, în timp ce un adaptor are un capăt coeziv.
Ligarea ADN este procesul de unire a două molecule de ADN, formând legături fosfodiester. Enzima numită ADN ligază catalizează această reacție. Este unul dintre pașii critici în domeniile biologice moleculare moderne, cum ar fi tehnologia ADN-ului recombinant și clonarea ADN-ului. Eficiența ligării depinde de capetele moleculelor de ADN care urmează să fie ligate. Există două tipuri de capete ADN ca capete lipicioase și capete contondente. Eficiența ligării este mare cu capete lipicioase decât cu capete contondente. Dacă moleculele de ADN țintă au capete tocite, vor fi utile moleculele numite adaptori sau linkeri. Adaptorii și linkerii sunt molecule de oligonucleotide sintetizate chimic care ajută la legarea ADN-ului. Au și site-uri interne de restricții. Adaptorul are un capăt lipicios și un capăt tocit, în timp ce dispozitivul de legătură are două capete tocite.
Ce este un linker?
Linker este o secvență de oligonucleotide sintetizată chimic care este dublu catenară. Linker are două capete contondente. Linkerul este folosit pentru a lega moleculele de ADN care au capete contondente la vectori. Conține unul sau mai multe site-uri de restricții interne. Aceste site-uri de restricție funcționează ca site-uri de recunoaștere pentru enzimele de restricție.
Figura 01: Linker
După ligatură, ADN-ul este restricționat din nou cu enzime de restricție pentru a produce capete coezive. Linkerii EcoRI și linkerii sal-I sunt linkeri folosiți în mod obișnuit.
Ce este un adaptor?
Un adaptor este o secvență de oligonucleotide dublu catenară folosită pentru a lega două molecule de ADN. Este o secvență scurtă cu un capăt contondent și un capăt lipicios sau coeziv. Prin urmare, constă dintr-o coadă monocatenară la un capăt, ceea ce sporește eficiența ligării ADN-ului.
Figura 02: Ligarea ADN-ului cu un adaptor
În plus, adaptorul are site-uri interne de restricții. Prin urmare, după ligatură, ADN-ul poate fi restricționat cu enzime de restricție adecvate pentru a crea un nou capăt proeminent. Un dezavantaj al adaptoarelor este că două adaptoare pot forma variatoare prin împerecherea bazei cu ei înșiși. Acest lucru poate fi evitat prin tratarea lor cu enzima numită fosfatază alcalină.
Care sunt asemănările dintre linker și adaptor?
- Atât linkerul, cât și adaptorul sunt secvențe de oligonucleotide scurte dublu catenare.
- Au site-uri interne de restricții.
- În plus, sunt molecule de ADN sintetizate chimic și sunt molecule sintetice.
- Ele pot lega două molecule de ADN împreună.
- După legarea linkerilor și adaptoarelor, ADN-ul este din nou restricționat cu enzime de restricție pentru a produce capete lipicioase.
Care este diferența dintre linker și adaptor?
Un linker este un duplex de oligonucleotide scurt sintetizat chimic cu două capete contondente. Un adaptor este un duplex scurt de oligonucleotide sintetizate chimic, cu un capăt lipicios și un capăt contondent. Astfel, aceasta este diferența cheie dintre linker și adaptor. Mai mult, adaptoarele pot forma dimeri, în timp ce linkerii nu formează dimeri. Deci, aceasta este o altă diferență semnificativă între linker și adaptor.
Mai jos este un rezumat al diferențelor dintre linker și adaptor sub formă tabelară.
Rezumat – Linker vs Adaptor
Linerul și adaptorul sunt două tipuri de oligonucleotide sintetizate chimic care sunt utile în legarea ADN-ului cu capătul tocit. Linkerul are două capete tocite, în timp ce adaptorul are un capăt tocit și un capăt coeziv. Deci, aceasta este diferența cheie dintre linker și adaptor. Sunt molecule dublu catenare care au locuri de restricție interne. Sunt utilizate pe scară largă în tehnologia ADN-ului recombinant și clonarea ADN-ului.
