Diferența cheie – VNTR vs STR
Studiile ADN au o utilitate imensă în înțelegerea și determinarea relațiilor filogenetice, diagnosticarea bolilor genetice și cartografierea genomului organismului. Mai multe tehnici asociate cu analiza ADN-ului sunt utilizate pentru identificarea unei anumite gene sau a unei secvențe de ADN într-un grup de ADN necunoscut. Sunt cunoscuți ca markeri genetici. Markerii genetici sunt utilizați în biologia moleculară pentru a identifica variațiile genetice între indivizi și specii. Repetarea în tandem cu număr variabil (VNTR) și repetarea în tandem scurtă (STR) sunt două tipuri de markeri genetici care arată polimorfism în rândul indivizilor. Ambele tipuri sunt ADN repetitiv necodificare, care sunt repetări în tandem. Ele sunt aranjate în cromozomi cap la coadă. VNTR este o secțiune a genomului în care secvența scurtă de nucleotide este repetată de mai multe ori. STR este o altă secțiune a ADN-ului din genom care este organizată ca unități care se repetă constând din două până la treisprezece nucleotide de o sută de ori. Diferența cheie dintre VNTR și STR este numărul de nucleotide dintr-o secvență care se repetă. Unitățile repetate ale VNTR constă din 10 până la 100 de nucleotide, în timp ce unitățile repetitive ale STR constă din 2 până la 13 nucleotide. VNTR și STR sunt utilizate pe scară largă în studiile criminalistice.
Ce este VNTR?
O repetare în tandem este o secvență scurtă de ADN care se repetă în mod cap la coadă la un anumit locus cromozomial. Nu există altă secvență sau nucleotidă în repetarea tandem. Există mai multe tipuri de repetări în tandem în genom. VNTR este un tip de repetare în tandem printre ele care are unități care se repetă constând din 10 până la 100 de nucleotide. VNTR este un tip de minisatelit. Aceste repetări în tandem pot fi găsite în mulți cromozomi. Sunt intercalate în genomul uman și sunt situate predominant în regiunile subtelomerice ale cromozomilor.
VNTR-urile arată polimorfism repetat în tandem între indivizi. Lungimea VNTR într-o anumită locație a cromozomului este foarte variabilă între indivizi datorită variației numărului de unități repetate organizate în acea secțiune de ADN. Prin urmare, VNTR poate fi folosit ca un instrument puternic în identificarea indivizilor, iar analiza VNTR este utilizată în multe domenii, inclusiv în genetică, cercetare în biologie, criminalistică și amprentare ADN. VNTR-urile au fost primii markeri genetici utilizați pentru a cuantifica grefarea transplantului de măduvă osoasă. VNTR-urile au fost, de asemenea, primii markeri polimorfi utilizați în profilarea ADN în criminalistică.
Figura 01: Variația VNTR la șase persoane
Analiza VNTR este efectuată prin polimorfismul lungimii fragmentului de restricție urmat de hibridizare sudică. Prin urmare, are nevoie de o probă de ADN relativ mare. Interpretarea profilului VNTR este, de asemenea, problematică. Din cauza acestor limitări, utilizarea VNTR în genetica criminalistică a fost limitată și este înlocuită cu analiza STR.
Ce este STR?
STR este o secțiune ADN foarte repetitivă, care constă din două până la treisprezece unități care se repetă de nucleotide organizate în tandem. STR este similar cu VNTR. Dar variază de la VNTR de la numărul de nucleotide dintr-o secvență care se repetă și numărul de repetări. STR este un tip de microsatelit.
Analiza STR implicată în măsurarea numărului exact de unități care se repetă. STR-urile sunt foarte variabile între indivizi, similar VNT-urilor. Profilurile STR diferă de la persoană la persoană. Prin urmare, analiza STR este utilizată în biologia moleculară pentru a compara loci specifici pe ADN din două sau mai multe probe. Prin urmare, STR-urile sunt considerate markeri genetici puternici în biologia moleculară. Oferă un instrument excelent pentru identificarea indivizilor datorită gradului lor ridicat de polimorfism și lungimii relativ scurte.
În prezent, STR-urile sunt instrumentul de polimorfism genetic analizat cel mai frecvent utilizat în genetica criminalistică. Majoritatea cazurilor criminalistice implică analiza polimorfă STR. Locii STR sunt răspândiți în întregul genom. Există mii de STR-uri localizate în cromozomi care pot fi utilizate în analiza criminalistică. Analiza STR nu implică polimorfismul lungimii de restricție precum analiza VNTR. Analiza STR nu taie ADN-ul cu enzime de restricție. Sonde specifice sunt folosite pentru a atașa regiunile dorite pe ADN și folosind tehnica PCR, lungimile STR sunt determinate.
Figura 02: variația STR între mostre
Care sunt asemănările dintre VNTR și STR?
- VNTR și STR sunt ADN noncoding.
- Ambele sunt repetări în tandem.
- Ambele prezintă polimorfism între indivizi datorită diferenței de lungime a secțiunii ADN.
- Ambele sunt folosiți ca markeri genetici puternici în amprentarea ADN și în studiile criminalistice.
Care este diferența dintre VNTR și STR?
VNTR vs STR |
|
| VNTR este un ADN repetitiv necodificare care are o secvență scurtă de nucleotide repetată în tandem. | STR este o secțiune ADN foarte repetitivă, care constă din două până la treisprezece unități care se repetă de nucleotide organizate în tandem. |
| Mărime | |
| VNTR sunt mai mari decât STR. | STR sunt mai mici decât VNTR. |
| Numărul de nucleotide în secvența repetată | |
| Unitatea care se repetă a VNTR constă din 10 până la 100 de nucleotide. | Unitatea care se repetă a STR constă din 2 până la 13 nucleotide. |
Rezumat – VNTR vs STR
VNTR și STR sunt doi markeri genetici puternici utilizați în biologia moleculară, în special în domeniul geneticii criminalistice. VNTR este un tip de minisatelit, iar STR este un microsatelit. VNTR și STR sunt ADN necodificare, foarte repetitiv. Sunt repetări în tandem. Structura generală a VNTR și STR sunt aceleași. Cu toate acestea, numărul de nucleotide din secvența care se repetă și lungimea sunt diferite. VNTR are secvențe repetate formate din 10 până la 100 de nucleotide. STR are secvențe care se repetă constând din 2 până la 13 nucleotide. Aceasta este diferența dintre VNTR și STR.
Descărcați versiunea PDF a VNTR vs STR
Puteți descărca versiunea PDF a acestui articol și o puteți utiliza în scopuri offline, conform notelor de citare. Vă rugăm să descărcați versiunea PDF aici Diferența dintre VNTR și STR.
