Diferența cheie dintre synteny și colinearity este că synteny este co-localizarea fizică a locilor genetici pe același cromozom la specii, în timp ce colinearitatea este co-localizarea fizică a loci genetici pe același cromozom la diferite specii care conservă aceeași comandă.
Sintenia și coliniaritatea sunt doi termeni care sunt folosiți interschimbabil în genomică. Ambii termeni descriu modelele de localizare a genelor pe cromozomi la diferite specii. Aceste aranjamente de gene înrudite între taxoni sunt informații valoroase atunci când se deduce descendența comună a genelor. Synteny se referă la co-localizarea fizică a locilor genetici pe același cromozom la specii. Coliniaritatea se referă la co-localizarea fizică a locilor genetici pe același cromozom la diferite specii care păstrează aceeași ordine. Prin urmare, este o formă de sintonia.
Ce este Synteny?
La diferite specii, există un set de gene situate pe același cromozom. Și această co-localizare fizică a genelor pe același cromozom la specii diferite este cunoscută sub numele de synteny. De asemenea, aceste gene se găsesc foarte aproape una de alta pe un singur cromozom. Ordinea genelor poate să nu fie neapărat aceeași. Dar, localizarea genelor una lângă alta pe același cromozom are loc în sintonia. Prin urmare, synteny descrie în principal modelul de distribuție al genelor pe un cromozom. Aceste modele de co-localizare a genelor indică relații între diferite specii și evoluția lor. Cu toate acestea, sintenia poate fi perturbată din cauza rearanjamentelor cromozomiale, cum ar fi translocări, inversare și fuziune cromozomială etc., duplicări, pierderi și recombinare omoloagă inegală.
Figura 01: Synteny
Se crede că toate genele legate sunt sintetice. Cu toate acestea, nu toate genele sintetice sunt neapărat legate. Ei posedă secvențe cromozomiale comune. Oamenii au multe gene sintetice cu alte mamifere. În plus, multe cereale au gene sintetice.
Ce este coliniaritatea?
Coliniaritatea este o formă mai specifică de sintenie în care un set de gene sunt localizate pe același cromozom de specii diferite în aceeași ordine ca și în specia ancestrală. Prin urmare, dacă există o abatere de la coliniaritate, acesta va fi un caracter filogenetic mai fiabil, deoarece coliniaritatea explică strămoșia comună a genelor.
Figura 02: Coliniaritate
Analiza coliniarității în mai multe direcții oferă informații mult mai fiabile despre speciile înrudite și despre filogenia lor.
Care sunt asemănările dintre sintonia și coliniaritate?
- Atât în sintonia, cât și în coliniaritate, un set de loci din două specii diferite este situat pe același cromozom.
- Acești termeni descriu co-localizarea fizică a locurilor genetice pe același cromozom.
- Coliniaritatea este o formă mai specifică de sintonia.
- Uneori, ambii termeni sunt folosiți interschimbabil în genomică.
- Dacă două regiuni au coliniaritate, ele sunt în mod evident sintenoase.
- Sunt utile în deducerea filogeniei.
Care este diferența dintre sintonia și coliniaritate?
Sintenia și coliniaritatea sunt doi termeni care sunt folosiți interschimbabil în genomică. Synteny se referă la co-localizarea fizică a unui set de gene în același cromozom la specii diferite. Coliniaritatea este o formă de sintonia în care setul de gene este co-localizat în aceeași ordine între diferitele specii. Prin urmare, aceasta este diferența cheie dintre sintenie și coliniaritate.
Rezumat – Sintenie vs Coliniaritate
Termenii sintenie și coliniaritate se referă la un set de gene care sunt situate pe același cromozom la specii diferite. De fapt, aceste gene sunt co-localizate în același cromozom la specii diferite. Synteny descrie co-localizarea fizică a setului de gene pe același cromozom la specii diferite, în timp ce coliniaritatea este o formă mai specifică de synteny în care setul de gene este co-localizat în aceeași ordine. Astfel, aceasta rezumă diferența dintre sintenie și coliniaritate.
