Transposon vs Retrotransposon
Transpozonii și retrotranspozonii sunt componente genetice ale ADN-ului și există diferențe majore între ele. Prezența procentuală a acestor materiale genetice variază în funcție de specie, iar funcțiile lor determină soarta organismului cu mutații și alte schimbări importante din punct de vedere fenotipic. Transpozonii și retrotranspozonii sunt gene sau colecții ale anumitor gene situate în catenele de ADN, iar modificările locațiilor lor au fost principalele cauze ale acestor consecințe. Cu toate acestea, acest articol intenționează să discute pe scurt funcțiile acestor gene și prezintă o comparație între transpozoni și retrotranspozoni.
Ce este transposonul?
Transpozonii sunt fragmente sau segmente interesante de ADN cu capacitatea de a schimba locația catenei de ADN sub formă de mecanism de tăiere și lipire. Datorită acestei naturi mobile a transpozonilor, aceștia sunt cunoscuți ca gene de săritură. Transpozonii sunt de două tipuri majore cunoscute ca transpozoni de clasa I și transpozoni de clasa a II-a. De obicei, tipul de clasa II este denumit transpozoni, iar tipul de clasa I este denumit retrotranspozoni. Procesele de tăiere și lipire a segmentelor mobile de ADN sunt reglementate de transpozaza enzimatică. Enzima se leagă de ambele capete ale transpozonului și taie legăturile fosfodiester ale catenei de ADN, izolează transposonul, îl mută la locul țintă și se leagă în noua locație. Cu toate acestea, acest proces este interesant de înțeles, deoarece unii transpozoni se pot deplasa doar în anumite locații numai din cauza incompatibilității secvențelor de bază cu site-ul țintă. Genele cu un capăt al unei singure catene au aceeași secvență de baze cu celăl alt capăt al celeil alte catene simple sunt transpozoni cu margini lipicioase, deoarece acestea se pot lega la situsurile catenei de ADN țintă cu aceeași secvență de baze ca la capetele lipicioase.. Cu toate acestea, această mobilitate a genelor poate provoca modificări ale genotipului, precum și ale fenotipului organismului. Oamenii de știință au inventat despre transpozoni și alimente și organisme modificate genetic în conformitate cu personalizările preferate au fost apoi puse la dispoziție. Culturile agricole foarte productive, antibioticele cu proprietăți medicinale, animalele de animale au fost unele dintre produsele dezvoltate avantajos după inventarea transpozonilor de către Barbara McClintock în anii 1940.
Ce este retrotransposonul?
Retrotranspozonii sunt transpozonii de clasa I, iar aceștia se deplasează prin genom prin mecanismul copierii și lipirii. Mecanismul mobilității retrotranspozonilor implică câțiva pași majori, cum ar fi copiarea segmentului de genă al catenei de ADN în ARN, transferul copiei de ARN la locul țintă, transcrierea secvenței de ARN înapoi la ADN folosind transcriptază inversă și inserare. a genei în noua locație a catenei de ADN a genomului. Cele două capete ale acestor retrotranspozoni au de obicei repetări terminale lungi cu aproximativ 1000 de perechi de baze, iar acestea sunt folosite ca caracteristici de identificare ale acestor gene. Aceste gene sunt ușor de amplificat în interiorul genomului, iar procentul de retrotranspozoni din genomul uman este de aproximativ 50%. Acestea ar putea fi destul de periculoase, deoarece virusul cauzator al SIDA, HIV și virusul leucemiei cu celule T au retrotranspozonii în genomul lor ARN. De fapt, acești virusuri pot lega retrotranspozonii în orice loc al catenelor de ADN uman cu utilizarea revers transcriptazei și integrazei. Enzima integrază funcționează în același mod ca transpozaza în transpozonii de clasa II.
Care este diferența dintre transposon și retrotransposon?
• Transposonii sunt gene de săritură de clasa a II-a, în timp ce retrotransposonii se încadrează în categoria de clasa I.
• Transpozonii funcționează cu enzima transpozază, în timp ce retrotranspozonii funcționează cu utilizarea a două enzime principale cunoscute sub numele de transcriptază inversă și integrază.
• Capetele terminalelor sunt mult mai lungi la retrotranspozoni decât la transpozoni.
• Transposonii sunt tăiați de la origine și lipiți la țintă; invers, retrotranspozonii fiind copiați de la origine în ARN și transcriși la țintă.
• Mișcarea retrotranspozonilor implică ARN, dar nu și în transpozoni.