Diferența cheie dintre SF1 și SF2 este capacitatea lor de a desface acizii nucleici. În timp ce SF1 derulează numai ADN-ul, SF2 desfășoară atât ADN-ul, cât și ARN-ul.
Helicaza este una dintre enzimele cheie care participă la procesul de replicare a ADN-ului, precum și la procesele de reparare a ADN-ului. Rolul principal al helicazei este de a participa la procesul de desfășurare pentru a facilita separarea moleculelor de ADN dublu catenar. Activitatea enzimei este esențială în timpul fazei de inițiere a replicării ADN-ului. Helicazele sunt împărțite în Super Family 1 și Super Family 2, în principal pe baza diferențelor lor structurale. În cadrul fiecărei Superfamilii, există mai multe tipuri diverse de helicaze.
Ce este SF1?
Helicaza Super Family 1 este un tip de helicază care cuprinde o structură hexamerică alături de proteina centrală internă, care descrie activitatea helicazei. SF1 helicaza este una dintre cele mai mari clase de helicaze și poate fi clasificată în continuare ca helicaze SF1A și helicaze SF1B. Proteine precum PcrA, Rep și UvrD aparțin clasei helicazelor SF1A. În comparație, proteine precum RecA și Dda aparțin clasei helicazelor SF1B. Funcțiile helicazelor SF1 variază foarte mult. Unele dintre funcțiile vitale ale helicazelor SF1 includ replicarea ADN-ului, recombinarea ADN-ului, procesarea fragmentelor Okazaki, formarea telomerilor și repararea prin excizie a nucleotidelor a leziunilor ADN. La unele specii bacteriene, tipul SF1 de helicaze participă și la transferul orizontal al genelor prin conjugare. În plus, în viruși, helicazele SF1 ajută la replicarea virală.
Figura 01: Acțiunea helicazei
Există multe motive diferite asociate cu structura helicazelor SF1. Acestea conțin cel puțin 7 motive conservate dintre toate tipurile diferite de helicaze SF1 (Q, I, Ia, II, III, IV, V și VI). Structura helicazei SF1 este un cristal, în care motivele sunt grupate împreună. Există un buzunar caracteristic de legare a ATP între motive și locul de legare a ADN-ului. Domeniile neconservate sunt distribuite pentru a menține integritatea structurală a moleculei de helicază. Aceste domenii pot varia între helicazele SF1A și helicazele SF1B.
Ce este SF2?
Super family 2 helicaze este unul dintre cele mai diverse grupuri de superfamilii de helicaze. Există multe tipuri de helicaze SF2, cum ar fi helicaze asemănătoare RecQ, RecG - precum helicaze, Rad3/XPD și helicaze NS3. Unele enzime de restricție, cum ar fi enzimele de restricție de tip I, se încadrează, de asemenea, în această categorie. Funcția generală a helicazelor SF2 este derularea ADN-ului dublu catenar. Cu toate acestea, unele tipuri de helicaze SF2 nu au capacitatea de a acționa complet ca enzime helicaze. Helicazele SF2 sunt utilizate pe scară largă și în procesarea ARN-ului. Familia DEAD-box a helicazelor SF2 participă la procesarea ARN, inclusiv la transcripție, splicing, procesarea translației și asamblarea complexului ARN-proteină.
Figura 02: Helicase
Structura helicazei SF2 conține, de asemenea, motive conservate. Cu toate acestea, unele domenii diferă ușor de cel al helicazei SF1. Acestea conțin, de asemenea, un domeniu de legare ATP, în afară de domeniul de legare ADN.
Care sunt asemănările dintre SF1 și SF2?
- SF1 și SF2 arată activitate helicază.
- În plus, ambii participă la replicarea și recombinarea ADN-ului.
- SF1 și SF2 sunt compuse din motive conservate.
- Ambele au un domeniu de legare ATP și un domeniu de legare ADN.
- Aceste forme sunt proteine cu mai multe domenii.
- În plus, dacă au loc mutații în oricare dintre tipuri, acestea vor avea efecte dăunătoare.
- Atât SF1, cât și SF2 sunt cruciale pentru a asigura continuitatea ciclului celular.
- SF1 și SF2 se găsesc atât la procariote, cât și la eucariote.
Care este diferența dintre SF1 și SF2?
SF1 și SF2 sunt două super familii de helicaze. Ele arată o mare diversitate. Diferența cheie dintre SF1 și SF2 este că SF1 este implicat în principal în derularea ADN-ului, în timp ce SF2 participă și la procesarea ARN-ului în timpul transcripției și traducerii. Când se compară diferitele motive ale proteinei, SF1 și SF2 diferă în primul rând pe baza motivului III și motivului IV. Chiar dacă au o similaritate structurală, helicazele SF1 formează structuri hexamerice toroidale, în timp ce SF2 nu formează aceste aranjamente structurale.
O altă diferență între SF1 și SF2 este că helicazele SF1 preferă mai mult nucleotidele de adenină, în timp ce helicazele SF2 preferă toate cele cinci nucleotide să țintească pentru desfășurare. Când comparăm direcția de desfășurare, helicazele SF1 se translocă numai în direcția 5’ până la 3’, în timp ce helicazele SF2 au capacitatea de a se transloca împreună cu acizii nucleici în ambele direcții.
Infograficul de mai jos prezintă diferențele dintre SF1 și SF2 sub formă tabelară pentru comparare una lângă alta.
Rezumat – SF1 vs SF2
Helicazele sunt un grup foarte important și divers de enzime care participă la replicarea ADN-ului. Cu toate acestea, datorită diversității sale mari, enzimele sunt clasificate în superfamilii. SF1 și SF2 sunt cele două mari super-familii de helicaze. În timp ce SF1 este asociat în principal cu procesarea legată de ADN, SF2 este asociat atât cu procesarea ADN-ului, cât și a ARN-ului. Astfel, aceasta este diferența cheie dintre SF1 și SF2. În plus, SF1 și SF2 diferă și prin aranjamentul lor structural, deoarece SF2 nu formează structuri hexamerice. Mutațiile helicazelor SF1 și SF2 vor duce la dezvoltarea cancerului ca urmare a dereglării ciclului celular și a altor mecanisme vitale, cum ar fi repararea ADN-ului.
