shRNA vs siRNA
În timpul procesului de interferență ARN (ARNi), expresia unei gene țintă este doborâtă cu specificitate și selectivitate ridicate. ARNi este un proces natural și implică ARN interferent mic (siRNA) și ARN scurt în ac de păr (shRNA) și shRNA bifuncțional. În prezent, ARNi este utilizat pe scară largă ca instrument pentru terapia personalizată a cancerului. Aplicațiile ARNi se fac practic cu moleculele de siARN dublu catenar sintetizate chimic și molecule de shARN pe bază de vector. Deși aceste două molecule au rezultate funcționale similare, ele diferă în structura lor; astfel, mecanismele moleculare de acțiune, căile ARN și efectele în afara țintă ale acestor două molecule diferă de asemenea.
shRNA
shRNA este o secvență de molecule mici de ARN care face o întoarcere strânsă în ac de păr care poate fi folosită pentru a reduce la tăcere expresia unei gene țintă în timpul ARNi. Exprimarea shARN este realizată de un vector, care poate fi fie un virus, fie o bacterie, fie prin livrarea de plasmide. Ele sunt sintetizate în nucleul celulelor și transportate în citoplasmă pentru procese ulterioare. Aceste molecule au căi similare de maturare ale miARN; astfel sinteza miARN a oferit bazele pentru înțelegerea sintezei shARN. Fie ARN polimeraza II sau III poate transcrie shARN prin promotorii ARN polimerazei II sau III. Avantajul utilizării shRNA-urilor este că au o rată relativ scăzută de degradare și turnover. Dezavantajul este că are nevoie de un vector de expresie, ceea ce poate cauza unele probleme de siguranță.
siRNA
siRNA-urile sunt molecule de ARN dublu catenar compuse din 20-25 de perechi de baze în lungime. Acestea sunt utilizate pentru suprimarea genelor prin tăcere orice genă cu secvență de nucleotide complementară în calea ARNi. Knockdown genei prin transfecția siARN este adesea nereușită din cauza efectului tranzitoriu; mai ales în celulele cu diviziune rapidă și suprimarea nu durează mai mult. Pentru a depăși această problemă, ARNsi este modificat prin introducerea unei structuri scurte în ac de păr. Această moleculă modificată este cunoscută apoi sub numele de shRNA. shRNA ar trebui convertit în siARN de către un Dicer pentru a-și continua funcția normală.
Care este diferența dintre shRNA și siRNA?
• Spre deosebire de siARN, shRNA are o structură suplimentară în ac de păr. shRNA este o versiune modificată a siRNA.
• shRNA necesită un vector de expresie, în timp ce siRNA nu.
• shRNA poate fi folosit pentru distrugerea pe termen lung, în timp ce siRNA poate fi utilizat numai pentru distrugerea pe termen scurt a genelor.
• Spre deosebire de suprimarea genică a ARNsi, suprimarea ARNsh este de lungă durată, iar dacă este inserat printr-un vector viral adecvat, poate produce efecte permanente de tăcere a genelor.
• Dicer este necesar pentru a converti shRNA înapoi în molecula de siARN pentru a-și îndeplini funcțiile normale.
