Diferența cheie dintre intronii din grupul I și grupul II este că la intronii din grupul I, reacția de splicing este inițiată de un cofactor de guanozină, în timp ce la intronii din grupul II, reacția de splicing este inițiată de adenozina internă.
Pre-ARNm este transcriptul primar care are atât introni, cât și exoni. Pre-ARNm ar trebui să se transforme în mARN înainte de traducere. Splicing-ul ARN sau splicingul pre-ARNm este o astfel de modificare post-transcripțională. În splicingul ARN, intronii sunt îndepărtați din molecula pre-ARNm și exonii sunt uniți. Intronii grupului I și grupului II sunt introni auto-splicing. Ele se desprind din molecula pre-ARNm fără ajutorul vreunei alte enzime. Prin urmare, sunt enzime ARN sau ribozime care își catalizează propria splicing din pre-ARNm. Mai mult, au capacitatea de a funcționa ca elemente mobile. În timpul splicing-ului, au loc o serie de reacții de trans-esterificare pentru a exciza intronul și a lega exonii. Aceste ribozime sunt prezente în toate cele trei domenii, inclusiv bacterii, arhee și eucariote.
Ce sunt intronii grupului I?
Intronii de grup I sunt un tip de ribozime cu auto-splicing care se găsesc în bacterii, bacteriofagi și eucariote (genom organic și nuclear). Ele se găsesc în genele esențiale. Ei sunt capabili să-și catalizeze propria splicing din molecula de pre-ARNm. Intronii din grupul I pot avea câteva sute până la trei mii de nucleotide. În plus, ele prezintă o mică asemănare de secvență între organisme.
Figura 01: Intronii Grupului I
Structurile secundare sunt foarte conservate în patru regiuni scurte. Există două etape de reacție de transesterificare de îmbinare. Intronii grupului I inițiază mecanismul de îmbinare prin atacul nucleofil al hidroxilului 3’ al unui cofactor de guanozină la locul de îmbinare 5P.
Ce sunt intronii Grupului II?
Intronii Grupului II sunt un tip de introni auto-splicing care se găsesc în organismele aparținând tuturor celor trei domenii. Sunt ribozime care își catalizează propriile reacții de splicing din pre-ARNm. Se găsesc în ARNr, ARNt și gene care codifică proteine. Dar nu se găsesc în genomul nuclear, spre deosebire de intronii grupului I.
Figura 02: Intronii Grupului II
Intronii din grupul II catalizează îmbinarea prin două etape de transesterificare similare cu intronii din grupul I. Aceste enzime inițiază reacția de îmbinare prin atacul nucleofil al 2′ OH al adenozinei locului de ramificare pe joncțiunea de îmbinare 5′. În timpul reacțiilor de îmbinare, intronii grupului II formează o structură asemănătoare lariatului. Mai mult, îmbinarea cu intron are loc în absența GTP.
Care sunt asemănările dintre intronii grupului I și grupului II?
- Intronii de grup I și de grup II sunt două tipuri de enzime ARN, ribozime care își catalizează propria îmbinare prin mecanisme diferite.
- Sunt ribozime mari.
- Ambele se găsesc în toate cele trei domenii.
- Sunt elemente mobile.
- În plus, se găsesc în ARNr, ARNt și gene care codifică proteine.
- Ambele enzime sunt folosite ca instrumente în biotehnologie și medicina moleculară pentru sisteme de eliminare/knock-out țintite ale genelor, livrare de gene sau sisteme de terapie genetică.
Care este diferența dintre intronii grupului I și grupului II?
Intronii din grupa I sunt ribozime care se găsesc în bacterii, bacteriofagi și genomi organici și nucleari eucarioți. Intronii din grupa II sunt ribozime care se găsesc în bacterii, arhee și organele eucariote. Mai mult, intronii grupului I inițiază reacția de îmbinare prin atacul nucleofil al hidroxilului 3′ al unui cofactor de guanozină la locul de îmbinare 5P, în timp ce intronii grupului II inițiază reacția de îmbinare prin atacul nucleofil al adenozinei 2′ OH a locului de ramificare pe joncțiune de îmbinare de 5′. Deci, aceasta este diferența cheie dintre intronii grupului I și grupului II.
În plus, intronii grupului II formează o structură asemănătoare lariatului în timpul îmbinării, în timp ce intronii grupului I nu se formează. Astfel, aceasta este o altă diferență semnificativă între intronii grupului I și grupului II. În plus, intronii grupului I se găsesc în genomul nuclear eucariotic, în timp ce intronii grupului II nu se găsesc în genomul nuclear eucariotic.
Infograficul de mai jos afișează diferențele dintre intronii grupului I și grupului II sub formă tabelară pentru comparare una lângă alta.
Rezumat – Grupul I vs Grupul II Introni
Intronii din Grupa I și II sunt ribozime mari care catalizează o reacție de transesterificare pentru a separa intronii din transcriptul primar. Ele se găsesc în toate cele trei domenii. Ambele sunt elemente genetice mobile. Mai mult, ele sunt folosite ca instrumente în biotehnologie și medicina moleculară. Cu toate acestea, intronii grupului I inițiază reacția de îmbinare prin atacul nucleofil al 3′ OH al unui cofactor de guanozină la locul de îmbinare 5P. Dar, intronii grupului II inițiază reacția de îmbinare prin atacul nucleofil al adenozinei 2′ OH a locului de ramificare pe joncțiunea de îmbinare 5′. Mai mult, intronii grupului II formează o structură asemănătoare lariatului în timpul îmbinării, în timp ce intronii grupului I nu formează o structură asemănătoare lariatului. Astfel, acesta este rezumatul diferenței dintre intronii grupului I și grupului II.
