Diferența cheie dintre MLVA și MLST este că MLVA utilizează polimorfismul secvențelor de ADN repetate în tandem pentru a caracteriza speciile microbiene, în timp ce MLST utilizează polimorfismul secvențelor de ADN ale fragmentelor interne ale mai multor gene menajere pentru a caracteriza speciile microbiene.
Tastarea microbiană este utilizată în mod normal pentru a determina sursa și căile infecțiilor. Confirmă sau exclude focarele. Tiparea microbiană urmărește, de asemenea, transmiterea încrucișată a agenților patogeni asociați asistenței medicale și recunoaște tulpinile virulente. Mai mult, tiparea microbiană evaluează eficacitatea măsurilor de control al speciilor microbiene patogene. MLVA și MLST sunt două tehnici biologice moleculare utilizate în tiparea microbiană.
Ce este MLVA?
Analiza VNTR cu loci multipli (MLVA) este o metodă biologică moleculară care utilizează polimorfismul secvențelor de ADN repetate în tandem pentru a caracteriza speciile microbiene. Este o metodă folosită pentru analiza genetică a anumitor specii microbiene.
În timpul primului pas al MLVA, fiecare locus VNTR vizat este amplificat prin PCR cu primeri specifici regiunii de flancare. Apoi fragmentele obținute sunt separate prin electroforeză pe un secvențior capilar. Genotiparea fiecărui locus și rezultatele compilate din fiecare probă permit caracterizarea unui microorganism a cărui specie este cunoscută. De asemenea, permite identificarea subspeciei prin tastarea alelelor și compararea cu bazele de date MLVA.
Figura 01: MLVA
Această metodă MLVA este mai selectivă decât metoda MLST. Mai mult, metoda MLVA nu necesită o etapă de secvențiere ADN. Astfel, face posibilă diferențierea subspeciilor apropiate sau a speciilor clonale.
Ce este MLST?
Multilocus sequence typing (MLST) este o tehnică care utilizează polimorfismul secvențelor de ADN ale fragmentelor interne ale mai multor gene menajere pentru a caracteriza speciile microbiene. MLST este o tehnică de analiză genetică pentru tiparea mai multor loci.
Figura 02: MLST
Este un tip de secvențiere de tipare folosit ca tehnică de referință pentru a distinge diferite tulpini de specii microbiene. Această metodă se bazează pe secvențierea genelor menajere. Genele menajere codifică în mod normal proteine esențiale ale agenților microbieni, cum ar fi o bacterie. Aceste secvențe de gene menajere au particularitatea de a prezenta un polimorfism stabil în timp. Prin urmare, diferențele de secvențe ale genelor menajere sunt suficiente pentru a distinge tulpinile unele de altele. Mai mult, prima schemă MLST care a fost dezvoltată a fost Neisseria meningitidis, agentul cauzal al meningitei și septicemiei meningococice. De la introducerea sa, MLST a fost folosit nu numai pentru agenții patogeni umani, ci și pentru agenții patogeni din plante.
Care sunt asemănările dintre MLVA și MLST?
- MLVA și MLST sunt două tehnici biologice moleculare utilizate în tiparea microbiană.
- Ambele tehnici pot fi folosite pentru analiza filogenetică microbiană.
- Ambele tehnici se bazează pe polimorfismul genetic.
- Ele pot fi utilizate pentru detectarea bolilor umane care cauzează agenți patogeni microbieni.
- Ambele tehnici trebuie efectuate de biologi moleculari calificați.
Care este diferența dintre MLVA și MLST?
MLVA este o tehnică care utilizează polimorfismul secvențelor de ADN repetate în tandem pentru a caracteriza speciile microbiene. Între timp, MLST este o tehnică care utilizează polimorfismul secvențelor de ADN ale fragmentelor interne ale mai multor gene de întreținere pentru a caracteriza speciile microbiene. Astfel, aceasta este diferența cheie dintre MLVA și MLST. În plus, metoda MLVA este mai selectivă decât metoda MLST.
Infograficul de mai jos prezintă diferențele dintre MLVA și MLST sub formă tabelară pentru comparație alăturată.
Rezumat – MLVA vs MLST
MLVA și MLST sunt două tehnici biologice moleculare utilizate în tiparea microbiană. MLVA folosește polimorfismul secvențelor de ADN repetate în tandem pentru a caracteriza speciile microbiene, în timp ce MLST utilizează polimorfismul secvențelor de ADN ale fragmentelor interne ale mai multor gene menajere pentru a caracteriza speciile microbiene. Deci, aceasta este diferența cheie dintre MLVA și MLST.
