Diferența cheie dintre tiocianatul de guanidină și clorhidratul de guanidină este că tiocianatul de guanidină este un denaturant proteic mai puternic, care este utilizat mai frecvent în izolarea ARN, în timp ce clorhidratul de guanidină este un denaturant proteic mai slab, care este mai puțin utilizat în izolarea ARN.
Denaturarea este procesul prin care proteinele își pierd structura cuaternară, structura terțiară și structura secundară care este în mod normal prezentă în starea lor nativă. Se poate realiza prin aplicarea unor tensiuni sau compuși externi, cum ar fi un acid sau o bază puternică, o sare anorganică concentrată, un solvent organic (alcool, cloroform), agitare, radiație sau căldură. Tiocianatul de guanidină și clorhidratul de guanidină sunt două tipuri diferite de denaturanți proteici.
Ce este tiocianatul de guanidină?
Tiocianatul de guanidină (GTC) este un agent de denaturare a proteinelor mai puternic, care este utilizat mai frecvent în izolarea ARN-ului. Este cunoscut și sub numele de izotiocianat de guanidiniu (GITC). Fiind un agent haotrop, este un compus chimic folosit de obicei ca denaturant proteic general. Un agent haotrop este o moleculă dintr-o soluție de apă care poate perturba rețeaua de legături de hidrogen dintre moleculele de apă. Acest lucru are un efect asupra stabilității stării native a altor molecule din soluție, cum ar fi macromolecule precum proteinele și acizii nucleici, prin slăbirea efectului hidrofob. Agenții haotropi precum tiocianatul de guanidină reduc cantitatea de ordine în structura proteinelor formate de moleculele de apă atât în vrac, cât și în cochilii de hidratare din jurul aminoacizilor hidrofobi. Acest lucru poate cauza denaturarea proteinelor.
Tiocianatul de guanidină poate fi folosit pentru a dezactiva viruși precum gripa care provoacă boli precum gripa spaniolă din 1918. Prin urmare, poate fi folosit în configurații medicale sau spitalicești. În plus, tiocianatul de guanidină este, de asemenea, utilizat pentru a liza celulele și particulele de virus în extracțiile de ARN și ADN. Aici, funcția tiocianatului de guanidină este de a ajuta la acțiunea de lizare și de a preveni activitatea enzimelor RNază și a enzimelor DNază prin denaturare. Aceste enzime ar deteriora altfel extractul (ARN sau ADN).
Ce este clorhidratul de guanidină?
Clorhidratul de guanidină (GdnHCl) este un denaturant proteic mai slab, care este mai rar utilizat în izolarea ARN-ului. Este, de asemenea, cunoscut sub numele de clorură de guanidiniu (GdmCl). Este sarea clorhidrat a guanidinei. Clorhidratul de guanidină este haotrop și unul dintre denaturanții utilizați în studiile fizico-chimice ale plierii proteinelor.
Figura 01: Clorhidrat de guanidină
Clorhidratul de guanidină are, de asemenea, capacitatea de a scădea activitatea enzimatică și de a crește solubilitatea moleculelor hidrofobe. În mod normal, la concentrații mai mari de clorhidrat de guanidină, proteinele își pierd structura ordonată. Proteinele tind să devină înfăşurate aleatoriu la această concentraţie de clorhidrat de guanidină. În configurațiile medicale sau spitalicești, clorhidratul de guanidină este indicat pentru reducerea simptomelor de slăbiciune musculară și oboseală ușoară asociată cu boala sindromul Eaton-Lambert. În plus, efectele secundare ale utilizării clorhidratului de guanidină pot include perist altismul, diareea și supresia fatală a măduvei osoase.
Care sunt asemănările dintre tiocianatul de guanidină și clorhidratul de guanidină?
- Tiocianatul de guanidină și clorhidratul de guanidină sunt două tipuri diferite de denaturanți proteici.
- Ambele denaturanți au guanidină în structurile lor.
- Sunt agenți haotropi.
- Ambele denaturanți pot fi utilizați pentru izolarea ARN.
- Ambele sunt folosite în configurații medicale sau spitalicești.
Care este diferența dintre tiocianatul de guanidină și clorhidratul de guanidină?
Tiocianatul de guanidină este un agent denaturant proteic mai puternic, care este utilizat mai frecvent în izolarea ARN, în timp ce clorhidratul de guanidină este un denaturant proteic mai slab, care este mai rar utilizat în izolarea ARN. Astfel, aceasta este diferența cheie dintre tiocianatul de guanidină și clorhidratul de guanidină. În plus, formula chimică a tiocianatului de guanidină este C2H6N4S, în timp ce formula chimică de clorhidrat de guanidină este CH5N3HCl.
Infograficul de mai jos prezintă diferențele dintre tiocianatul de guanidină și clorhidratul de guanidină în formă tabelară pentru comparație una lângă alta.
Rezumat – Tiocianat de guanidină vs clorhidrat de guanidină
Tiocianatul de guanidină și clorhidratul de guanidină sunt două tipuri diferite de denaturanți proteici. Ambii denaturanți sunt haotropi. Tiocianatul de guanidină este un agent denaturant proteic mai puternic, care este utilizat mai frecvent în izolarea ARN, în timp ce clorhidratul de guanidină este un denaturant proteic mai slab, care este mai puțin utilizat în izolarea ARN. Deci, aceasta rezumă diferența dintre tiocianatul de guanidină și clorhidratul de guanidină.
