Diferența cheie dintre CRISPR și CRISPR Cas9 este că CRISPR (repetare palindromică scurtă interspațiată în cluster) este un mecanism de apărare imună procariotă care apare în mod natural, în timp ce CRISPR cas9 este o nuclează Cas9 ghidată de ARN, care face parte din adaptarea CRISPR. sistemul imunitar.
CRISPR este un sistem imunitar de apărare antiviral găsit în bacterii și arhee. Este o familie de secvențe de ADN găsite în genomul bacterian. Este alcătuită din secvențe distanțiere care sunt derivate din fragmente de ADN ale bacteriofagelor care i-au infectat anterior. În infecțiile virale ulterioare, bacteriile folosesc aceste secvențe pentru a distruge ADN-ul viral. Secvențele CRISPR au repetări palindromice scurte și secvențe distanțiere. Mai mult decât atât, secvențele de separare repetate CRISPR au adesea gene asociate care codifică proteinele Cas. Cas9 este o endonuclează ghidată de ARN. Împreună cu secvențele CRISPR, proteina Cas9 acționează ca un sistem imunitar adaptativ în bacterii împotriva bacteriofagelor.
Ce este CRISPR?
CRISPR înseamnă Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats. Este un grup de secvențe ADN găsite în genomul bacterian. Funcționează ca un mecanism natural de apărare în bacterii și a fost identificat pentru prima dată în E. coli. În bacterii, acționează ca protecție imunitară adaptivă, în special împotriva bacteriofagelor. Prin urmare, este un mecanism specific secvenței.
Figura 01: CRISPR
Sistemul CRISPR conține mai multe secvențe repetate ADN cu segmente scurte. Aceste repetări sunt palindromice, având aceeași secvență de bază atunci când citiți de la 5’ la 3’, în timp ce ceal altă oferă aceeași secvență când citiți de la 3’ la 5’. În plus, repetările sunt identice. Ele sunt situate între secvențe scurte de ADN „distanțare” care nu sunt identice. Dar aceste secvențe de ADN distanțier sunt similare sau se potrivesc cu ADN-ul bacteriofag străin. Genele asociate cu CRISPR sunt cunoscute ca gene asociate CRISPR sau gene Cas. Genele Cas codifică proteinele Cas care sunt helicaze sau nucleaze. Helicazele desfășoară ADN-ul în timp ce nucleazele taie ADN-ul. În general, când luăm în considerare CRISPR, este un sistem imunitar de bacterii care acționează împotriva bacteriofagelor (bacteriile care infectează viruși).
Ce este CRISPR Cas9?
Cas9 sau proteina 9 asociată CRISPR este o endonuclează bacteriană ghidată de ARN. Prin urmare, este o enzimă care recunoaște și taie ADN-ul țintă (în special ADN bacteriofag) complementar ARN-ului ghid. Ea efectuează clivaj specific firului. Proteina Cas9 este codificată de o genă asociată CRISPR. CRISPR cas9 este sistemul de nuclează CRISPR-Cas9 ghidat de ARN care poate fi utilizat ca platformă de țintire și editare ADN programabilă cu ARN pentru editarea genomului, perturbarea transcripțională, modularea epigenetică și imagistica genomului. Acest sistem CRISPR cas9 este foarte popular în sistemele actuale de editare a genomului.
Figura 02: CRISPR Cas9
În prezent, sistemul CRISPR/Cas9 este utilizat pentru a modifica sau modifica genomul mamiferului fie prin reprimarea transcripției, fie prin activare. Celulele de mamifere pot răspunde la rupturile ADN-ului mediate de CRISPR/Cas9 prin adoptarea unui mecanism de reparare. Poate fi realizat fie folosind metoda de îmbinare a capătului non-omologă (NHEJ), fie repararea direcționată la omologie (HDR). Ambele mecanisme de reparare au loc prin introducerea de ruperi dublu-catenare. Acest lucru are ca rezultat editarea genelor de mamifere. NHEJ poate duce la ablația mutațiilor genelor și poate fi folosit pentru a crea o pierdere a efectelor funcției. HDR poate fi utilizat pentru introducerea de mutații punctuale specifice sau pentru introducerea de segmente de ADN de lungime variabilă. În prezent, sistemul CRISPR/ Cas este utilizat în domeniile aplicațiilor terapeutice, biomedicale, agricole și de cercetare.
Care sunt asemănările dintre CRISPR și CRISPR Cas9?
- Cas9 face parte din sistemul CRISPR Cas.
- Sistemul Crisper cas9 este un sistem imunitar care se găsește în mod natural în bacterii.
Care este diferența dintre CRISPR și CRISPR Cas9?
CRISPR este un grup de secvențe ADN găsite în genomul bacterian care funcționează ca un sistem natural de apărare împotriva bacteriofagelor. Se compune din repetări palindromice scurte interspațiate în mod regulat, distanțiere și gene asociate. În schimb, cas9 este o proteină 9 asociată CRISPR, care este o enzimă endonuclează ghidată de ARN. Recunoaște și scindează ADN-ul catenelor duble ale virusurilor. De fapt, este o parte a sistemului de apărare CRISPR. Deci, aceasta este diferența cheie dintre CRISPR și CRISPR cas9.
Rezumat – CRISPR vs CRISPR Cas9
Sistemul CRISPR Cas este un sistem de apărare microbiană. CRISPR este un grup de secvențe ADN format din repetări scurte palindromice, secvențe distanțiere și gene asociate. Cas9 este o proteină Cas care este o endonuclează ghidată de ARN. Proteina CRISPR și Cas9 formează un sistem imunitar care funcționează împotriva infecțiilor bacteriofagice la bacterii. Proteina Cas9 este capabilă să scindeze ADN-ul viral străin și să-l perturbe. CrRNA ghidează cas9 să recunoască ADN-ul viral. Prin urmare, sistemul CRISPR cas9 este un sistem imunitar natural care se găsește în bacterii împotriva virușilor. Astfel, acesta este rezumatul diferenței dintre CRISPR și CRISPR cas9.
