Diferența cheie dintre retrotranspozonii LTR și non-LTR este că retrotranspozonii LTR sunt un tip de retrotranspozoni care au repetări terminale lungi în structura lor, în timp ce retrotranspozonii non-LTR sunt un tip de retrotranspozoni care nu au repetări terminale lungi în structura lor.
Retrotranspozonii (elementele transpozonabile de clasa I sau transpozonii prin intermediari ARN) sunt un tip de componentă genetică care se poate copia și lipi în diferite locații genomice. Ei efectuează acest lucru prin conversia ARN-ului înapoi în ADN printr-un proces numit transcripție inversă folosind un intermediar de transpunere ARN. Există două tipuri principale de retrotranspozoni ca retrotranspozoni LTR și non-LTR
Ce sunt retrotransposonii LTR?
Retrotransposonii LTR sunt un tip de retrotranspozoni care au repetări terminale lungi în structura lor. Catenele lungi de ADN repetitiv pot fi găsite la fiecare capăt al unui retrotransposon LTR. Acestea sunt cunoscute sub numele de repetări terminale lungi (LTR). Fiecare LTR are o lungime de câteva sute de perechi de baze. Retrotranspozonii LTR au de obicei peste 5 kilobaze lungime. Mai mult, între repetițiile terminale lungi, există gene care pot fi transcrise echivalent cu genele retrovirusului gag și pol. Aceste gene se suprapun astfel încât codifică o protează care procesează în mod normal transcriptul rezultat în produse genice funcționale.
Figura 01: Retrotranspozoni LTR
Gena Gag a retrotranspozonilor face un produs care se asociază cu alte transcripte de retrotranspozoni pentru a forma particule asemănătoare virusului. Gena Pol produce produse care includ enzime precum reverse transcriptaza, integraza și domeniile ribonucleazei H. Enzima transcriptază inversă realizează transcrierea inversă a ADN-ului retrotranspozon. Enzima integraza integrează ADN-ul retrotranspozonului în ADN-ul genomului eucariotic. Domeniile ribonucleazei H sunt utile în scindarea legăturilor fosfodiester între intermediarii ARN. Retrotranspozonii LTR codifică, de asemenea, transcrieri cu situsuri de legare a ARNt, astfel încât să poată fi supuși transcripției inverse destul de ușor. În plus, deoarece retrotransposonul conține informații despre genomul eucariot, acesta poate insera copii ale lui însuși în alte locații genomice din interiorul unei celule eucariote.
Ce sunt retrotransposonii non-LTR?
Retrotranspozonii non-LTR sunt un tip de retrotranspozoni care nu au repetări terminale lungi în structura lor. La fel ca retrotranspozonii LTR, retrotranspozonii non-LTR conțin, de asemenea, gene pentru transcriptază inversă, proteină de legare a ARN, nuclează și, uneori, domeniile H ribonucleazei. Dar le lipsesc repetițiile lungi ale terminalului; în schimb, au repetări scurte care pot avea o ordine inversă a bazelor una lângă alta. Proteinele de legare a ARN-ului se leagă de intermediarul de transpunere a ARN-ului, iar nucleazele rup legăturile fosfodiesterului dintre nucleotide din acizii nucleici.
Figura 02: Retrotranspozoni LTR și non-LTR
Deși sunt retrotranspozoni, ei nu pot efectua transcripția inversă folosind un intermediar ARN în același mod ca retrotranspozonii LTR. Acest lucru se datorează faptului că retrotranspozonii non-LTR nu conțin secvențe care leagă tARN. Prin urmare, un retrotransposon non-LTR transcris în ARNm și tradus în proteine acționează ca transcriptază inversă. Transcriptaza inversă face o copie ADN a ARN-ului retrotranspozonului non-LTR care poate fi integrată în genom la un nou sit. În plus, retrotranspozonii non-LTR se împart în două tipuri: LINE (elemente nucleare intercalate lungi) și SINE (elemente nucleare intercalate scurte).
Care sunt asemănările dintre retrotranspozonii LTR și non-LTR?
- LTR și retrotranspozoni non-LTR sunt cele două tipuri principale de retrotranspozoni.
- Ambele tipuri conțin gene pentru enzime precum transcriptaza inversă, proteina de legare a ARN, nuclează și domeniile ribonucleazei H.
- Ele pot fi găsite în genomul uman.
- Ambele tipuri sunt importante din punct de vedere evolutiv.
Care este diferența dintre retrotranspozonii LTR și non-LTR?
Retrotransposonii LTR au repetări terminale lungi în structura lor, în timp ce retrotransposonilor non-LTR le lipsesc repetări terminale lungi în structura lor. Astfel, aceasta este diferența cheie dintre retrotranspozonii LTR și non-LTR. În plus, retrotranspozonii LTR au repetări directe lungi care sunt doar o secvență de baze care se repetă. Pe de altă parte, retrotranspozonii non-LTR au repetări scurte care pot avea o ordine inversă a bazelor unul lângă celăl alt.
Infograficul de mai jos prezintă diferențele dintre retrotranspozonii LTR și non-LTR în formă tabelară pentru comparație unul lângă altul.
Rezumat – Retrotranspozoni LTR vs non-LTR
LTR și retrotranspozonii non-LTR sunt cele două tipuri principale de retrotranspozoni. Retrotransposonii LTR au repetări terminale lungi în structura lor, în timp ce retrotransposonii non-LTR nu au repetări terminale lungi în structura lor. Deci, aceasta este diferența cheie dintre retrotranspozonii LTR și non-LTR.
