Diferența cheie dintre ADN-ul genomic și izolarea ADN-ului plasmidic este că izolarea ADN-ului genomic vizează extracția ADN-ului genomic, în timp ce izolarea ADN-ului plasmid vizează extracția ADN-ului plasmidial al bacteriilor.
Izolarea ADN-ului este un proces chimic folosit pentru a izola ADN-ul de la diferite specii sau din probe diferite. Izolarea ADN-ului este importantă în tehnicile de biologie moleculară din aval, cum ar fi electroforeza pe gel, reacția în lanț a polimerazei și tehnicile de secvențiere a ADN-ului. Prin urmare, izolarea ADN-ului este un proces chimic esențial în studiile biologice moleculare. Pe baza scopului cercetării, uneori este necesară izolarea ADN-ului genomic. În plus, unele studii se concentrează pe izolarea ADN-ului plasmid din bacterii. Izolarea ADN-ului genomic este procesul de izolare a ADN-ului genomic dintr-o probă procariotă sau eucariotă. Etapele izolării diferă în funcție de tipul de celulă în care se izolează ADN-ul. Izolarea ADN-ului plasmidic este procesul de izolare a ADN-ului plasmidic dintr-o celulă bacteriană. În comparație cu izolarea ADN-ului genomic, procesul general este complex în izolarea ADN-ului plasmid.
Ce este izolarea ADN-ului genomic?
Izolarea ADN-ului genomic este procesul de extragere a întregului ADN genomic al unui organism. Acest proces particular implică trei evenimente principale. Acestea sunt, liza celulară sau liza nucleară, degradarea proteinelor sau proteoliza și precipitarea ADN-ului genomic. Etapa de liză poate diferi în funcție de tipul de celulă. La procariote, deoarece există un perete celular de peptidoglican, primul pas ar trebui să fie defalcarea peretelui celular. Pe de altă parte, la eucariote, etapa de liză implică defalcarea membranei plasmatice și a membranei nucleare pentru a scoate ADN-ul în exterior. În schimb, pași speciali sunt esențiali pentru lizarea pereților celulelor vegetale și fungice.
Figura 01: Izolarea ADN-ului genomic
În consecință, odată ce etapa de liză este finalizată, în cele din urmă ADN-ul va ajunge la supernatant. Simultan, degradarea proteinei are loc și în soluție datorită adăugării proteinazei K. Următorul pas este separarea ADN-ului genomic și a proteinelor degradate unele de altele. Prin urmare, proteinele degradate se separă prin precipitare permițând ADN-ului genomic să rămână în supernatant. După precipitarea proteinelor, ADN-ul genomic poate fi precipitat și resuspendat într-un tampon adecvat până când este necesar pentru experiment.
ADN-ul genomic, care este ADN-ul liniar, conține toată informația genetică a unui organism. Cu alte cuvinte, genomul este materialul ereditar al unui organism viu care este responsabil pentru toate activitățile structurale și funcționale ale celulei. Este alcătuită din secvențe de ADN codificatoare și necodante. La izolarea ADN-ului genomic, acesta include întregul genom al organismului.
Ce este izolarea ADN-ului plasmide?
Izolarea ADN-ului plasmid este un proces special și mai complicat de izolare a ADN-ului. Plasmidele sunt ADN extracromozomial prezent în majoritatea celulelor bacteriene. Sunt ADN circular latent care sprijină bacteriile să supraviețuiască în condiții dure de mediu. ADN-ul plasmidic constă din gene rezistente speciale care oferă avantaje suplimentare bacteriilor, cum ar fi rezistența la antibiotice, proprietățile de virulență și proprietățile toxice.
Figura 02: Izolarea ADN-ului plasmid
Izolarea ADN-ului plasmidic implică, de asemenea, trei procese principale; liza celulară, proteinoliza și precipitarea ADN-ului. Deși mecanismul biochimic de izolare este similar cu cel al izolării ADN-ului genomic, procesul este mai complex decât acesta. Procesul de liză celulară este cel mai important proces din această procedură. Cel mai important, ADN-ul genomic și ADN-ul plasmidic nu trebuie amestecate unul cu celăl alt. Prin urmare, un proces de liză mult mai blând se încorporează în procedura de izolare a ADN-ului plasmidic. Prin urmare, în majoritatea procedurilor de izolare a ADN-ului plasmidic se utilizează detergentul; dodecil sulfat de sodiu pentru liza celulară.
Care sunt asemănările dintre ADN-ul genomic și izolarea ADN-ului plasmidic?
- Izolarea ADN-ului genomic și a ADN-ului plasmidic se concentrează pe extragerea ADN-ului unui organism.
- De asemenea, ambele urmează același proces general, care include liza celulară, degradarea proteinelor și precipitarea ADN-ului.
- În plus, ADN-ul rezultat al ambelor procese este important pentru procesele din aval.
- În plus, ambele procese de izolare includ pașii de purificare și stocare a ADN-ului în condiții de depozitare specificate.
- În plus, proteinaza K este folosită în ambele metode pentru a degrada proteinele.
Care este diferența dintre ADN-ul genomic și izolarea ADN-ului plasmid?
Izolarea ADN-ului genomic se concentrează pe extragerea întregului ADN genomic al organismului țintă, în timp ce izolarea ADN-ului plasmidic se concentrează pe izolarea numai ADN-ului plasmid din specia bacteriană particulară. Prin urmare, aceasta este diferența cheie dintre ADN-ul genomic și izolarea ADN-ului plasmid. Mai mult, o altă diferență între ADN-ul genomic și izolarea ADN-ului plasmidic este în procedură. Izolarea ADN-ului genomic este o procedură mai puțin complexă în comparație cu izolarea ADN-ului plasmidic. Prin urmare, atunci când se izolează ADN-ul plasmidic, este necesar să se ia măsuri de precauție pentru a preveni amestecarea ADN-ului genomic și plasmidic unul cu celăl alt.
Infograohicul de mai jos oferă detalii suplimentare despre diferența dintre ADN-ul genomic și izolarea ADN-ului plasmid.
Rezumat – ADN genomic vs izolarea ADN-ului plasmid
Izolarea ADN-ului este un proces important în tehnicile de biologie moleculară. Există două tipuri de ADN și anume ADN genomic și ADN plasmid (ADN extra-cromozomial). Pe baza cerinței, unele proceduri au fost efectuate pentru a izola ADN-ul genomic, în timp ce unele proceduri se concentrează pe izolarea numai a ADN-ului plasmid din bacterii. Prin urmare, pașii implicați în ambele procese diferă ușor unul de celăl alt. Cu toate acestea, procesul general este același în ambele izolații. ADN-ul izolat al ambelor procese are o utilizare imensă în procesele din aval, cum ar fi clonarea, electroforeza pe gel și reacțiile în lanț a polimerazei. La sfârșitul protocolului de izolare a ADN-ului genomic, întregul ADN genomic al organismului poate fi izolat ca produs final, în timp ce la sfârșitul protocolului de izolare a ADN-ului plasmidic, ADN-ul plasmid al bacteriei respective poate fi izolat ca produs final. Prin urmare, aceasta este diferența dintre ADN-ul genomic și izolarea ADN-ului plasmid.
